Exploration de la diversité microbienne dans les procédés d'épuration des eaux à boues activées

par Rakia Chouari

Thèse de doctorat en Microbiologie

Sous la direction de Denis Le Paslier.

Soutenue en 2003

à Paris 11 .


  • Résumé

    Il est maintenant bien documenté que des divisions entières de micro-organismes des domaines Bacteria et Archaea demeurent inconnues du point de vue de leur diversité, de leur génome et de leur physiologie. Afin de mieux appréhender l'étendue de cette diversité, nous avons mené une étude phylogénétique à grande échelle de la microflore présente dans les procédés d'épuration des eaux à boues activées. L'analyse phylogénétique de plus de 4000 séquences d'ADNr 16S a montré que près de 90% de ces séquences représentent de nouvelles unités taxonomiques. Elle a permis également la caractérisation de nombreuses nouvelles lignées phylogénétiques et de divisions candidates. De plus, cette analyse nous a permis de développer de nouveaux outils moléculaires (amorces PCR et sondes) afin de mieux caractériser et quantifier cette diversité. Des cultures en anaérobiose ont également été initiées afin de cultiver certains de ces micro-organismes

  • Titre traduit

    Microbial diversity in an activated sludge waste water treatment plant


  • Résumé

    It is now well established that many phylums of microorganisms within Bacteria and Archaea domains remain completely unknown in their diversity, their genome and their physiology. In order to better characterise this diversity extent, we performed a large scale phylogenetic study of the microflora present in activated sludge processes. The phylogenetic analysis of more than 4000 16S rDNA sequences showed that almost 90% of these sequences represent novel taxonomic units. It also allowed the characterisation of many new phylogenetic lineages and candidate divisions. Moreover, this analysis enabled us to develop new molecular tools (PCR primers and probes) in order de better describe and quantify this diversity. Anaerobic cultures have also been initiated to cultivate some of these microorganisms

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Informations

  • Détails : 136-[20] f.
  • Annexes : Bibliogr. f. 126-136

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  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Châtenay-Malabry, Hauts-de-Seine). Service Commun de la Documentation. Section Pharmacie.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 03PA114822
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