Oligonucléotides et peptides dirigés contre l'ARN TAR du VIH-1 : expression d'un aptamère in cellulo

par Gaëlle Kolb

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et médicales. Biologie - Santé

Sous la direction de Claudine Boiziau.

Soutenue en 2003

à Bordeaux 2 .


  • Résumé

    Le virus de l'Immunodéficience Humaine de type 1 (VIH-1) présente un génme ARN très structuré. Une structure située dans la région 5' promotrice de ce virus appelée TAR ("Trans-Activation Responsive element") interagit avec fdes facteurs protéiques et provoque une transactivation de la transcription virale. Nous ciblons cet élément TAR par une méthode de sélection in vitro (SELEX). Un aptamère ARN (R06) affin et spécifique de l'ARN TAR a été identifié. Des sélections in vitro de ligands peptidiques par "mRNA" et "phage display" ont été développées contre l'élément TAR. Puis, l'aptamère R06 a été exprimé dans trois compartiments cellulaires : le cytoplasme, le noyau et le nucléole. Parallèlement cet aptamère a été testé en chimie HNA ("Hexitol Nucleic Acid") pour son interaction avec TAR et sa capacité à inhiber la transactivation de la transcription in vitro et in cellulo.

  • Titre traduit

    Oligonucleotides and peptids targeted against HIV-1 TAR RNA : in cellulo expression of an aptamer


  • Résumé

    HIV-1 contzins highly structured motifs in its RNA genome. One element refered to as TAR (Trans-Activation Responsive element) is implicated in the transactivation of viral transcription when interacting with regulatory factors. In the laboratory, we use routinely in vitro selections (SELEX) to select high affinity ligands against the TAR element. An RNA aptamer called R06 which interact tightly and specifically with TAR RNA by forming a so-called kissing complex was identified. Peptid in vitro selection by "mRNA display" and phage display were driven against TAR RNA. Beside, the efficiency of this aptamer in a cellular context was evaluated. On the one hand we expressed R06 into cells by targetting three compartments, namely, cytoplasm, nucleus and nucleolus. On the other hand, the evaluation of a HNA-modified version of R06 aptamer was conducted for the interaction with TAR RNA and for the ability to inhibit transactivation of transcription in vitro and in cellulo.

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Informations

  • Détails : 105 f.
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. 117 réf.

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  • Bibliothèque : Université de Bordeaux. Direction de la Documentation. Bibliothèque des Sciences du Vivant et de la Santé.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : CMTB 2003-1064
  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire de santé (Paris). Pôle pharmacie, biologie et cosmétologie.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : MFTH 6073
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