Etude et développement de techniques QSAR pour la recherche de molécules d'intérêt thérapeutique : criblage virtuel et analyse de chimiothèques

par Nicolas Baurin

Thèse de doctorat en Chimie et physicochimie des composés d'intérêt biologique

Sous la direction de Luc Morin-Allory.

Soutenue en 2002

à Orléans .


  • Résumé

    La chimie informatique permet d'intégrer dans un modèle mathématique (QSAR) les données structurales et biologiques obtenues au cours du processus de recherche et développement d'un futur médicament (Activité=f (Structure). Le chimiste informaticien peut utiliser de tels modèles pour proposer les molécules que l'on testera ultérieurement. Dans le premier chapitre, à partir des données structures/activité d'un ensemble de ligands affins pour la cible protéique I2, nous avons construit un modèle 3D-QSAR CoMFA reliant quantitativement l'affinité I2 d'une molécule à sa description structurale tridimensionnelle. La description structurale est un échantillonnage tridimensionnel des propriétés électrostatiques, stériques et lipophiles d'une molécule. Dans le deuxième chapitre, à partir des données structures/activité d'un ensemble d'inhibiteurs de l'enzyme COX-2, nous avons construit plusieurs modèles 2D-QSAR reliant le pouvoir d'inhibition COX-2 d'une molécule à sa description structurale bidimensionnelle. La description structurale ne prend pas en compte la conformation de la molécule décrite et estime les propriétés électrostatiques, lipophiles et pharmacophoriques d'une molécule en termes de surface moléculaire. Après l'exploration de la méthodologie utilisant une technique 3D-QSAR (CoMFA) dans le premier chapitre, nous explorons dans ce deuxième chapitre la méthodologie utilisant huit techniques 2D-QSAR. Nous abordons également une application des modèles 2D-QSAR au criblage virtuel d'une chimiothèque de deux millions de structures. Dans le troisième chapitre, nous avons analysé la base de données moléculaire dont les deux millions de molécules correspondantes sont disponibles auprès de 15 organismes ou fournisseurs différents. L'architecture de programmation C++ mise en place pour ces réalisations (traitement de larges matrices numériques, algorithme génétique) est présentée en annexe.

  • Titre traduit

    Study and development of QSAR techniques for drug discovery : virtual screening and analysis of chemical libraries


  • Pas de résumé disponible.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe sous forme papier

Informations

  • Détails : 205 p.
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 193-205

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université d'Orléans. Service commun de la documentation.Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TS 19-2002-43
Voir dans le Sudoc, catalogue collectif des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche.