L'extension polypeptidique N-terminale de la lysyl-ARNt synthétase de mammifère : un domaine fonctionnel de fixation générale des ARNt

par Mathilde Francin-Allami

Thèse de doctorat en Biophysique moléculaire

Sous la direction de Marc Mirande.


  • Résumé

    Une étape importante pour la fidélité de la traduction du message génétique en protéine est l'aminoacylation des ARNt par les aminoacyl-ARNt synthétases. Ce travail de thèse a permis de mettre en évidence que l'extension N-terminale spécifique de la lysyl-ARNt synthétase (LysRS) de hamster est un domaine de fixation générale des ARNt. Cette extension agit en synergie avec le corps catalytique de l'enzyme pour fournir à la LysRS une forte capacité à lier les ARNt. La présence de cette extension N-terminale améliore l'efficacité catalytique de l'enzyme. Elle fixe préférentiellement le bras accepteur de l'ARNt Lys, et faciliterait le positionnement de son extrémité 3' dans le site actif de l'enzyme. La substitution systématique des résidus lysine et arginine de l'extension N-terminale de la LysRS de hamster a conduit à l'identification de quatre résidus particulièrement impliqués dans la fonction de ce domaine de fixation des ARNt. Ces résidus sont intégrés dans le motif conservé KxxxK(K/R)xxK. La LysRS native de hamster est capable d'aminoacyler sans discrimination n'importe quelle minihélice acceptrice d'ARNt. Le système lysine eucaryote a perdu une partie de sa spécificité comparé au système lysine des procaryotes. Toutefois, l'anticodon de l'ARNt Lys semble être un élément d'identité suffisamment puissant pour éviter toute mésaminoacylation in vivo. Chez les eucaryotes, les concentrations en ARNt non aminoacylés sont suboptimales comparés aux constantes catalytiques des aminoacyl-ARNt synthétases. En plus de la sélection des ARNt, la capture des ARNt s'avère être aussi une priorité pour la LysRS de mammifère, mais également pour d'autres aminoacyl-ARNt synthétases eucaryotes, ce qui pourrait expliquer l'acquisition par ces enzymes eucaryotes d'un domaine supplémentaire de fixation générale des ARNt.

  • Titre traduit

    The N-terminal domain of mammalian lysyl-tRNA synthetase: a functional tRNA-binding domain


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Informations

  • Détails : 1 vol. (235 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliog. p. 122-137 (201 Réf.)

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  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : TH 61809
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