Aptamères anti-ARN TAR du VIH-1 : Caractérisation de complexes boucle-boucle et évaluation de leurs effets sur la transcription du génome viral

par Fabien Darfeuille

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et médicales. Biologie - Santé

Sous la direction de Carmelo Di Primo.

Soutenue en 2002

à Bordeaux 2 .

mots clés

• Transcription génétique
• VIH (virus)
• Interactions ARN-protéine
• Facteurs de transcription
• ARN viral

Résumé

Un aptamère structuré en tige-boucle a été identifié par sélection in vitro dirigé contre le motif ARN TAR de Virus de l'Immunodéficience Humaine de type-1. Des analogues résistants aux nucléases dérivés de cet aptamère ARN ont été synthétisés en série phosphoramidate (NP) et 2'-O-méthyl (OMe). Ils se structurent également en tige-boucle et forment un complexe boucle-boucle avec l'ARN TAR avec une affinité de l'ordre du nanomolaire comme démontré par des expériences de mobilité électrophorétique retardée et de résonance plasmonique de surface. Les déterminants structuraux qui contribuent à la stabilité du complexe aptamère ARN-TAR (complémentarité des boucles et les résidus G, A fermant la boucle de l'aptamère) demeurent cruciaux pour la stabilité des complexes aptamères modifiés-TAR. Les deux analogues OMe et NP inhibent sélectivement la transcription in vitro médiée par la protéine Tat ce qui en fait des candidats intéressants pour des évaluations dans un contexte cellulaire.

Titre traduit

Aptamers tragetd against the TAR RNA of the Human Immunodeficiency Virus (HIV-1) : characterization of loop-loop complexes : effects on the HIV-1 Tat mediated transcription

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