Etude des relations structure-dynamique-fonction d'une calciproteine : la calcium vector protein

par ISABELLE THERET

Thèse de doctorat en Sciences biologiques fondamentales et appliquées

Sous la direction de Joël Mispelter.

Soutenue en 2001

à Paris 6 .

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  • Résumé

    La calcium vector protein (cavp, 18. 3 kda), une calciproteine a motifs ef-hand organisee en deux domaines distincts est abondante dans les muscles, les gonades et la moelle epiniere d'un cephalochordate (amphioxus). Elle est extraite en forte association avec sa proteine cible, la cavpt. Sur les 4 sites de fixation potentiels, seuls les deux sites situes dans le domaine c-terminal sont fonctionnels et fixent des ions calcium avec des affinites tres differentes (ka 3 = 1. 9 10 6 m 1 et ka 4 = 7. 3 10 3 m 1). Afin de determiner les caracteristiques structurales et fonctionnelles, nous avons realise une etude par resonance magnetique nucleaire de la cavp. La proteine cavp integrale et les domaines isoles c-cavp (81-161) et n-cavp (1-86) ont ete clones et exprimes. Les structures des domaines isoles sont organisees, stables et similaires a celles des calciproteines a motifs ef-hand. La fixation des ions calcium sur le domaine c-cavp est sequentielle et provoque une transition d'un etat apo en globule fondu a une structure saturee en calcium, ouverte et presentant une importante surface hydrophobe, comparable a celle d'un domaine regulateur. Par opposition, la n-cavp adopte une structure compacte et fermee avec des helices- presque anti-paralleles. Elle ne subit aucun changement conformationnel avec la concentration en calcium. Les etudes structurales de la n-cavp et la c-cavp ont permis de proposer un modele pour la cavp en presence de calcium. Les parametres de relaxation nucleaire de l'azote 15 de la c-cavp ont ete mesures a 4 champs magnetiques differents. L'ajustement des fonctions de densites spectrales, obtenues par la methode des densites spectrales reduites a ete effectue dans le cadre du formalisme de lipari-szabo. Ces etudes de la dynamique interne de la c-cavp ont mis en evidence un phenomene d'echange conformationnel lent au niveau de la boucle inter-motif et des mouvements rapides (ps-ns) de plus grande amplitude.

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Informations

  • Détails : 202 p.
  • Annexes : 209 ref.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Disponible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 2001
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