Etude de la structure de deux oligonucleotides simples brins non auto-complementaires d(gttggcccagga) et d(tcctgggccaac)

par AICHA BOURZEGUE BOUBAHRI

Thèse de doctorat en Sciences biologiques fondamentales et appliquées

Sous la direction de GUY DODIN.

Soutenue en 2001

à Paris 6 .

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  • Résumé

    Les adn simples brins interviennent dans de nombreux processus biologiques comme la transcription, la replication et la recombinaison. Ce role est assure par la grande flexibilite des adn mono brins. Dans ce travail, la structure de deux oligonucleotides simples brins non auto complementaires 5d(gttggcccagga)3 (c3) et 5d(tcctgggccaac)3 (g3) a ete etudiee par electrophorese sur gel de polyacrylamide (page), dichroisme circulaire (dc), uv et rmn 1h (1d et 2d). Les resultats obtenus a partir des techniques experimentales utilises ont permis de conclure que le dodecamere c3 forme une epingle a cheveux a temperature ambiante. La structure de c3 est flexible et evolue d'une facon continue d'une espece compacte (comme le montre le gel de polyacrylamide a 4\c) vers un simple brin desordonne en augmentant la temperature. Le dodecamere complementaire de c3 (g3) se structure differemment. A basse temperature, g3 forme deux doubles brins partiels avec un decalage de bases dans les deux cas et une faible proportion de monomere structure (comme le montre la mobilite electrophoretique a 4\c). Les deux doubles brins decales sont stabilises par quatre paires de bases de type watson-crick (c-g) et un mesappariement (g-g ou a-g dans chaque cas). Quand la temperature augmente, l'equilibre se deplace vers la forme monomerique. Celle ci se destructure apres 30\c. Le melange stchiometrique de c3 et g3 forme exclusivement un double brin stable (comme le montre le gel de polyacrylamide a 4 et 20\c). Le dimere obtenu est largement favorise par rapport aux auto associations formees par c3 et g3 separement.


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Informations

  • Détails : 102 p.
  • Annexes : 130 ref.

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  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 2001
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