Variabilité de Burkholderia vietnamiensis au contact de semences de riz en germination

par Lucie Miché

Thèse de doctorat en Sciences. Ecologie microbienne

Sous la direction de Jacques Balandreau.

Soutenue en 2001

à Lyon 1 .

Le jury était composé de Jacques Balandreau.


  • Résumé

    Dans cette etude sur les etapes initiales de l'interaction entre une bacterie typique de la rhizosphere, burkholderia vietnamiensis tvv75 et sa plante hote, le riz, le comportement des bacteries inoculees a la plante en conditions gnotobiotiques a ete etudie pendant trois jours au maximum. Cela a necessite de modifier le protocole classique de desinfection des semences a l'hypochlorite, qui s'est avere mutagene. En testant les exsudats des plantules sur un ensemble de souches d'e. Coli comportant des fusions de l'operon lux avec divers promoteurs lies au stress, l'activation des genes uspa (proteine universelle de stress), grpe, lon, et dnak (proteines heat shock) ainsi que katg (proteine de stress oxydatif) a pu etre detectee, mais pas celle du systeme sos. Les alk(en)ylresorcinols extraits des jeunes racines induisent les memes promoteurs que les exsudats, et pourraient donc participer a l'effet observe. Des effets mutagenes sos independants ont ensuite ete recherches sur la souche tvv75. La frequence des mutations ponctuelles produisant la resistance a la rifampicine n'etant pas significativement augmentee, le plasmide pgbg1 (schneider et al. , 2000) a ete utilise. Dans cet outil, tout une gamme de mutations se produisant dans une zone cible de 1,1 kb conduit au phenotype selectionable tet r. Une augmentation d'un log de la frequence des mutants tet r a ete observee en presence de la semence en germination. 75% de ces mutants resultent de la transposition des sequences d'insertion is402, is407 et is1416, presentes dans la souche en 12, 3 et 11 copies respectivement. En outre, la souche tvv75 montre une exceptionnelle variabilite, les mutateurs y ayant une frequence de 5%, qui depasse 30% parmi les mutants rif r. Ainsi par une combinaison de stress et d'effet mutagene, le riz en germination induit une augmentation de diversite dans la population de burkholderia qui l'entoure, amplifiee par la capacite exceptionnelle de la souche a generer des mutateurs.


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Informations

  • Détails : 1 vol. (133 f.)
  • Annexes : Bibliogr. f. 104-130

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  • Bibliothèque : Université Claude Bernard (Villeurbanne, Rhône). Service commun de la documentation. BU Sciences.
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