Analyse de remaniements genomiques chez saccharomyces cerevisiae : implication du retrotransposon tyl dans l'apparition de duplications et role de courtes sequences en repetition directe dans la formation de deletions

par ANNE WELCKER

Thèse de doctorat en Sciences biologiques fondamentales et appliquées

Sous la direction de Jean-Luc Souciet.

Soutenue en 2000

à Strasbourg 1 .

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  • Résumé

    Chez les eucaryotes, les rearrangements chromosomiques tels que deletions, insertions, translocations, inversions et duplications de sequences contribuent a la plasticite genomique et sont un des moteurs de l'evolution. Pour etudier leurs mecanismes de formation, nous avons developpe au laboratoire un systeme genetique permettant, chez saccharomyces cerevisiae, la selection positive au locus de remaniements chromosomiques spontanes. Trois types de rearrangements ont pu etre obtenus dans ce systeme : insertion de retrotransposon tyl, duplication et deletion. Dans un premier temps, nous avons recherche les effets de la modification du taux de transposition des elements tyl sur les rearrangements genomiques. L'analyse des evenements obtenus suggere un role indirect du retrotransposon tyl dans le mecanisme de duplication et de deletion de sequences, par l'intermediaire d'une ou plusieurs des fonctions impliquees dans la retrotransposition. Ensuite, nous avons analyse au niveau moleculaire les 128 clones selectionnes dans ce travail. Sur les 52 insertions d'elements tyl obtenues, 95% se font dans la meme orientation. Les duplications peuvent avoir lieu sur n'importe lequel des 16 chromosomes de s. Cerevisiae. Deux duplications, situees sur le chromosome x, ont ete caracterisees moleculairement. Les 16 deletions se repartissent en 7 classes differentes, dont six presentent des sequences de 7 a 13 pb en repetition directe a leurs bornes. Une classe produit une proteine chimere fonctionnelle. En contexte rad52, le taux des deletions est significativement augmente. Ceci suggere un evenement de recombinaison non homologue impliquant de courtes sequences d'adn en repetition directe, selon un mecanisme d'appariement de sequences simple brin. Les resultats de ce travail montrent que le crible utilise est un systeme favorable pour etudier les proteines et les interactions mises en jeu pour la formation de rearrangements chromosomiques, tels que duplications et deletions.

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Informations

  • Détails : 234 p.
  • Annexes : 150 ref.

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  • Bibliothèque : Université de Strasbourg. Service commun de la documentation. Bibliothèque Blaise Pascal.
  • Disponible pour le PEB
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