Etude des interactions faibles entre composants elementaires de biomolecules par spectroscopie de transfert d'electron de rydberg

par SOPHIE CARLES

Thèse de doctorat en Physique

Sous la direction de JEAN-PIERRE SCHERMANN.

Soutenue en 2000

à Paris 13 .

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  • Résumé

    Ce travail porte sur l'etude de petits agregats moleculaires, choisis pour leur implication dans un certain nombre de situations rencontrees en biologie. Ces agregats sont composes de petites molecules liees entre elles par des liaisons faibles de type van der waals ou hydrogene. L'objectif est de determiner les conformations adoptees en phase gazeuse de ces agregats neutres et les proprietes energetiques associees comme leurs affinites electroniques et leurs energies de liaison. La methode utilisee repose sur la confrontation entre resultats experimentaux obtenus par spectroscopie de transfert d'electron de rydberg (ret) et resultats de calculs ab initio. La spectroscopie ret consiste a former des ions negatifs par attachement non perturbatif d'electrons de tres faible energie. Si les systemes moleculaires etudies possedent des caracteristiques electrostatiques adequates (par exemple, un moment dipolaire superieur a 2,5 debye), des anions d'un type particulier, appele multipolaire, de structures geometriques tres voisines de celles de leurs parents neutres, peuvent etre formes et observes. Nous deduisons les informations sur la structure des systemes moleculaires neutres a partir de mesures en jets croises et de la modelisation des conditions de formation de ces anions. Nous avons systematiquement applique cette methode a differents systemes qui modelisent a une echelle tres locale des problemes de reconnaissance moleculaire biospecifique. Nous avons principalement considere quatre facteurs pouvant influencer les processus de reconnaissance : les liaisons faibles qui s'etablissent entre deux biomolecules (systemes modeles adenine-pyrrole et adenine-imidazole), l'influence de molecules d'eau (adenine-pyrrole, adenine-imidazole, indole, dimethylsulfoxyde hydrates), la rigidite entrainee par l'existence de ponts disulfures (methyldisulfure, ethyldisulfure, propyldisulfure), enfin la flexibilite de conformations (pyroglutaminol, prolinol, ethyl pyroglutamate).


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Informations

  • Détails : 156 p.
  • Annexes : 124 ref.

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  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH 2000 007
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