Analyse de la variabilite d'expression et de structure de genes cibles du facteur de transcription opaque-2 chez le mais (zea mays l. ) - recherche d'associations avec le polymorphisme au locus o2

par LUCIANO CONSOLI

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de CATHERINE DAMERVAL.

Soutenue en 2000

à PARIS 11, ORSAY .

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  • Résumé

    Le facteur de transcription opaque-2 et les genes sous son controle representent un systeme de regulation potentiellement important vis-a-vis de la composition du grain de mais. L'objet de cette these est l'evaluation du polymorphisme de structure et d'expression de certains genes cibles d'o2, et la recherche de polymorphismes au locus o2 responsables de la variabilite observee. Nous avons evalue les polymorphismes des genes ahas108 et cyppdk1 par caps, et leurs quantites d'arnm ainsi que celle du gene lkr/sdh dans les grains en developpement par northern blot. Les proteines de zeines totales, et 42 isoformes de zeines revelees par electrophorese bidimensionnelle ont ete quantifiees dans les grains murs. Une population de 53 lignees et 6 mutants o2 ont ete utilises. Le sequencage d'alleles sauvages et mutants a permis d'identifier un allele mutant produisant une proteine non fonctionnelle et un allele nul. La presence d'une proteine non fonctionnelle engendre une reduction plus drastique de la quantite des -zeines de 22 kda et des -zeines de 14 kda. Le gene cyppdk1 s'est revele plus polymorphe dans les regions codantes que le gene ahas108, alors que les niveaux de polymorphisme sont comparables au niveaux des promoteurs. Un effet genetique significatif a ete observe pour tous les caracteres, sauf pour quelques isoformes de zeines. Certaines lignees ont un phenotype proche des mutants, suggerant un controle polygenique de l'expression des genes cibles. Le nombre reduit de sites polymorphes rflp au locus o2 associe aux caracteres renforce cette hypothese. Toutefois, d'autres facteurs peuvent expliquer ce resultat : i) les sites responsables de la variabilite des caracteres n'ont pas ete mis en evidence ii) le faible effectif rend impossible la separation de l'effet de l'allele de l'effet du fond genetique. L'hypothese d'un role important d'o2 dans la variabilite des genes etudies devrait etre precisee par la recherche d'associations avec les donnees de sequence d'o2.


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  • Détails : 94 p.
  • Annexes : 217 ref.

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  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH2014-014580
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