Modelisations markoviennes : deux applications en epidemiologie

par YANN LE STRAT

Thèse de doctorat en Sciences médicales. Sciences biologiques fondamentales et appliquées

Sous la direction de Jean-Christophe Thalabard.

Soutenue en 2000

à Paris 6 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Ce travail presente deux modelisations markoviennes en epidemiologie. Pour la premiere application, l'objectif principal etait de mesurer l'effet de l'allaitement, variant au cours du temps, sur la survenue du retour de fertilite au cours du post-partum. Les donnees provenant d'une large et recente etude multicentrique de l'oms ont ete analysees en considerant differents modeles statistiques. Apres discussion des caracteristiques principales des donnees, le modele non-parametrique lineaire d'aalen, ainsi qu'une version discrete du modele de cox ont ete proposes et compares au modele semi-parametrique continu de cox. Un modele de markov de regression a egalement ete developpe. L'interet d'une telle modelisation markovienne est compare avec les outils classiques utilises en analyse de survie. Sa capacite a simuler des sequences d'allaitement et a mesurer leur influence sur le retour de fertilite est soulignee. Dans la seconde application, des modeles de markov caches (mmcs) ont ete construits et illustres sur deux jeux de donnees : le premier sur des donnees de grippe et syndromes grippaux en france avec un melange de distributions gausiennes et l'autre sur des cas de poliomyelite aux etats-unis avec un melange poissonien. Apres une breve introduction des mmcs, les trois principales etapes necessaires a l'utilisation d'un mmc ont ete developpees 1) l'evaluation de la fonction de vraisemblance, 2) la maximisation de la fonction de vraisemblance et 3) l'estimation de la sequence la plus vraisemblable des etats. Pour l'etape 1, l'algorithme de baum-welch est rappele. A l'etape 2, differents algorithmes de maximisation sont discutes et compares notamment l'algorithme em et certaines de ses versions stochastiques telles que sem


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  • Détails : 243 p.
  • Annexes : 286 ref.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Disponible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 2000
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