Analyse du polymorphisme du gene opaque-2 chez le mais (zea mays l. ) et recherche de facteurs genetiques impliques dans la variation quantitative de son transcrit

par AGNES LEFEVRE

Thèse de doctorat en Sciences biologiques fondamentales et appliquées

Sous la direction de CATHERINE DAMERVAL.

Soutenue en 2000

à Paris 6 .

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  • Résumé

    Les analyses genetiques et moleculaires ont montre que le locus opaque-2 (o2) code pour un facteur de transcription de la famille des leucine-zipper, et est implique dans le controle de l'expression coordonnee de plusieurs genes des voies de biosynthese des reserves de l'albumen (proteiques ou carbonees). Le gene o2 est de ce fait un modele d'etude original pour examiner comment le polymorphisme au niveau d'un facteur de regulation peut jouer un role dans la variation de caracteres phenotypiques. La comparaison de sequences du gene o2 de huit alleles mutants et sauvages a permis de caracteriser les alterations moleculaires responsables du phenotype mutant. Nous avons mis en evidence deux types d'alleles : l'un est du a une deletion dans la region codante qui conduit a une proteine tronquee non fonctionnelle. L'autre est un allele nul car il ne possede ni transcrits, ni proteine o2. Le deuxieme aspect du travail a porte sur des alleles sauvages et leur activite transcriptionnelle. La recherche d'elements cis et trans regulateurs de l'expression du gene o2 a ete realisee a l'aide de deux strategies. L'etude d'associations statistiques entre le polymorphisme rflp au locus o2 et la quantite d'arnm o2 au sein d'une population de 51 lignees diversifiees a permis de mettre en evidence l'existence d'elements cis en amont du gene, regulant la quantite de transcrits dans des grains ages de 20 jours. Une recherche de qtl de la quantite d'arnm o2 au sein d'une population de 121 lignees recombinantes revele egalement l'implication de plusieurs regulateurs polymorphes agissant en trans sur la variabilite de la quantite de transcrits au stade precoce du grain. Ce travail a montre l'interet des deux approches utilisees pour la mise en evidence de facteurs polymorphes regulant l'expression d'un gene. L'analyse du polymorphisme de la quantite de proteine o2 s'avererait une etude complementaire tres pertinente pour evaluer l'implication du gene o2 dans la regulation de ces genes cibles.


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Informations

  • Détails : 130 p.
  • Annexes : 188 ref.

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  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 2000
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