Etude par RMN de la structure des dimères de la séquence d'ARN SL1-23mer initiant la dimérisation chez VIH-1Lai

par Frédéric Girard

Thèse de doctorat en Biophysique moléculaire

Sous la direction de Gérard Lancelot.

Soutenue en 2000

à Orléans .


  • Résumé

    Comme chez tous les rétrovirus, le génome du virus de l'immunodéficiance humaine (VIH) est constitué de deux copies identiques d'ARN génomique. Celles-ci sont liées de manière non covalente au niveau de leur région 5'-terminale. Ce phénomène de dimérisation interfère avec différentes étapes clés du cycle rétroviral. Il est entre autre corrélé aux étapes d'encapsidation de l'ARN génomique et de maturation des particules virales. De plus, la participation d'une protéine virale, la protéine de nucléocapside (NC), a été démontrée dans le développement de ce processus de dimérisation. L'inhibition de la dimérisation par des stratégies anti-sens ou l'inactivation de la NC par des inhibiteurs représentent autant de nouvelles voies de traitements potentiels de l'infection virale causée par le VIH. Notre travail, réalisé par RMN, porte sur la séquence d'ARN SL1 initiant la dimérisation chez VIH-1Lai. Après avoir isolé les deux conformères d'ARN impliqués dans ce phénomène, nous avons mis en évidence leurs caractéristiques structurales. Celles-ci permettent d'avancer des hypothèses quant à leur différence de stabilité relative. De plus, nous avons pu établir le mécanisme sur lequel repose l'évolution conformationnelle du dimère instable vers la forme dimérique stable. Nous avons finalement montré que la NC permet d'activer cette évolution conformationnelle. L'étude du complexe ARN/NC met en évidence des interactions spécifiques déjà décrites dans le cas d'autres complexes impliquant la NC. Ces investigations structurales constituent une base d'étude dans les stratégies de "drug design" impliquant le développement d'inhibiteurs susceptibles d'interférer avec les sites d'interactions ARN/ARN ou ARN/NC.

  • Titre traduit

    NMR structural studies of SL1 RNA sequence that initiates HIV-1Lai genomic RNA dimerization


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Informations

  • Détails : 175 p.
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 151-175

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  • Bibliothèque : Université d'Orléans. Service commun de la documentation.Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TS 19-2000-41
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