Optimisation de la selection recurrente reciproque du palmier a huile (elaeis guineensis jacq. ) par l'utilisation conjointe des index de selection et des marqueurs moleculaires

par ABDUL RAZAK PURBA

Thèse de doctorat en Sciences biologiques fondamentales et appliquées

Sous la direction de Serge Hamon.

Soutenue en 2000

à l'ENSA MONTPELLIER .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Le programme d'amelioration du palmier a huile a l'iopri (indonesian oil palm research institute = l'institut indonesien pour les recherches sur le palmier a huile) a debute dans les annees soixante dix apres l'introduction de plusieurs populations selectionnees d'origine africaine. Un programme de selection recurrente reciproque (srr) entre ces origines et l'origine deli (introduite en 1848) a ete engage. Ce programme necessitait de classer les parents utilises en fonction de leur aptitude a la combinaison. Cependant, l'estimation precise de la valeur genetique de parents est rendue difficile a cause des contraintes liees a la biologie de la plante et du caractere desequilibre des essais genetiques disponibles. L'objectif de ce travail de these a ete d'estimer les parametres genetiques des parents en utilisant toutes les informations disponibles : les donnees genealogiques, les donnees agronomiques et les donnees de marqueurs moleculaires. L'exploitation conjointe de l'ensemble de ces informations permet de mieux gerer la variabilite et le controle de la recombinaison. Les aflp (amplified fragment length polymorphism) et les isoenzymes ont ete utilises pour estimer la distance genetique entre individus ou entre populations ainsi que pour structurer les materiels de selection de l'iopri. Des ecarts a l'equilibre de hardy-weinberg et une separation des parents, en au moins trois groupes, ont ete detectes dans les populations etudiees. L'organisation de la variabilite genetique obtenue ouvre donc une discussion sur la separation stricte des populations du palmier a huile en deux groupes heterotiques applique actuellement dans le schema d'amelioration de srr. Les donnees agronomiques et de pedigree des parents testes au premiere cycle de selection a l'iopri ont utilise pour ameliorer l'estimation de leurs parametres genetiques en utilisant la methode de blup (best linear unbiased predictor). En depit du fait que la variabilite genetique du groupe deli soit moins importante que celle du groupe africain, la divergence des individus de deli, choisis comme parents des hybrides testes, entraine d'une contribution comparable de ce groupe a la variabilite genetique. Les resultats ont aussi demontre la coherence de la methode de blup en determinant le classement des geniteurs en se basant sur leurs valeurs genetiques additives. En effet, ces valeurs au stade adulte peuvent etre lineairement expliquees par celles au stade jeune, ce qui implique une possibilite de simplifier le schema srr en effectuant une selection precoce. Les correlations entre les valeurs observees et les valeurs predites des performances des croisements sont en general assez moderees mais sont envisageables pour une selection basee sur la production d'huile, ce qui, en fait, est l'objectif des selectionneurs du palmier a huile. D'autres part, le recours a des marqueurs moleculaires permet de predire les performances de croisements aussi efficacement que celui des donnees de pedigree. Les informations moleculaires peuvent donc etre utilisees si les informations de pedigree sont obscures ou indisponibles. La connaissance sur la structure et la valeur genetique des parents a permis de choisir les meilleurs combinaisons et d'eliminer les mauvais croisements des tests a realiser. Du point de vue pratique, les resultats donneront une contribution significative sur la production de semences et des clones du palmier a huile.


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  • Détails : 161 p.
  • Annexes : 150 ref.

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