Pretraitement et segmentation d'images par mise en uvre de techniques basees sur les equations aux derivees partielles : application en imagerie microscopique biomedicale

par SOPHIE SCHUPP

Thèse de doctorat en Sciences médicales

Sous la direction de DANIEL BLOYET.

Soutenue en 2000

à Caen .

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  • Résumé

    La these offre trois volets : une analyse de l'apport des edp pour le pretraitement et la segmentation, une methode de segmentation basee sur les edp et une application en imagerie microscopique. Dans le chapitre un, la presentation des pretraitements par edp s'appuie sur le modele physique de diffusion non lineaire, elle se poursuivent avec les methodes d'analyse multiechelle qui s'appuient sur l'information courbure et s'acheve avec les modeles de diffusion anisotrope dont les filtres de chocs adaptes au filtrage et a la conservation des contours. Le chapitre deux porte sur la detection des frontieres par des methodes variationnelles dont les contours actifs et les methodes par ensembles de niveaux. Leur problematique est identifiee : initialisation, choix des parametres, comportement face aux phenomenes de ruptures topologiques. Le chapitre trois presente un modele de pretraitement integrant les composantes liees a la diffusion, la reaction et le choc. Une extension aux images couleurs est proposee. La morphologie continue est la formulation par edp des filtres de nivellement ainsi que des operateurs de morphologie mathematique. Le chapitre quatre est consacre a la segmentation par edp avec le modele geometrique non regularise, implemente par les methodes a progression rapide, a partir duquel la lpe continue et les diagrammes de voronoi sont obtenus. Le chapitre cinq presente une methode de segmentation automatique fondee sur les outils des chapitres precedents. L'initialisation automatique, etape cruciale des contours actifs, se fait en trois etapes : regularisation par diffusion non lineaire, detection de germes par outils morphologiques, classification floue. La localisation est effectuee par la lpe continue formalisee avec les edp. La description de la classification floue est suivie de quelques exemples d'application : cytologie, histologie et l'os trabeculaire. Le chapitre six est consacre a la validation de la methode sur une application en immunomarquage nucleaire.

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Informations

  • Détails : 211 p.
  • Annexes : 131 ref.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université de Caen Normandie. Bibliothèque universitaire Sciences - STAPS.
  • Disponible pour le PEB
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