Edition des arn mitochondriaux des plantes. Etude de cytidine desaminases vegetales : caracterisation d'une famille multigenique chez arabidopsis thaliana

par SANDRINE EMMANUELLE FAIVRE NITSCHKE

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de JEAN MICHEL GRIENENBERGER.

Soutenue en 1999

à Strasbourg 1 .

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  • Résumé

    Il existe dans les mitochondries et les chloroplastes des plantes superieures un phenomene d'edition consistant en la conversion de cytidines en uridines en des sites specifiques des transcrits. D'apres certains travaux et par analogie avec d'autres systemes d'edition connus, le mecanisme le plus probable serait une desamination de la base cytosine catalysee par une enzyme de type cytidine desaminase (cda). Cette these presente les resultats obtenus lors de la recherche de cytidine desaminases dans les cellules vegetales. Une premiere approche a consiste en l'isolement de genes chez arabidopsis thaliana codant pour des cytidine desaminases. Ainsi, 9 genes at-cda differents ont ete identifies codant pour des proteines comportant le motif caracteristique du motif conserve du site actif des cda. D'apres leur homologie avec d'autres cda connues, ceux-ci auraient une origine procaryotique. Huit d'entre eux sont regroupes dans un meme locus de 25 kb. L'expression de ces genes a ete etudiee dans la plante d'a. Thaliana et a permis de montrer que tous sont exprimes bien que faiblement, avec un niveau d'expression superieur pour le gene at-cda1. Une etude biochimique de certaines des proteines at-cda surexprimees chez e. Coli a egalement ete realisee, et a conduit a la conclusion que la proteine at-cda1 est une cytidine desaminase classique. Afin de pouvoir attribuer un role possible a certaines de ces proteines dans l'edition des arn mitochondriaux, leur affinite pour les arn a ete testee et leur localisation subcellulaire etudiee in vivo. Toutefois, d'apres les resultats de ces experiences, aucune des proteines testees ne semblent intervenir dans ce phenomene. Les implications possibles de variations de structures de ces proteines sont discutees. D'une autre part, la caracterisation de proteines mitochondriales a ete realisee par des approches immunologiques et biochimiques. Il a ainsi pu etre montre qu'il existe une activite cytidine desaminase dans les mitochondries. Une proteine de 110 kda peut etre immunodetectee dans des fractions enrichies en proteines ayant de l'affinite pour les acides nucleiques. Une purification de proteines a ete tentee simultanement par suivi de l'activite cytidine desaminase et immunodetection a l'aide d'anticorps specifiques sans donner de resultats concluants.


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Informations

  • Détails : 192 P.
  • Annexes : 280 REF.

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  • Bibliothèque : Université de Strasbourg. Service commun de la documentation. Bibliothèque Blaise Pascal.
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