If3 d'escherichia coli. Etudes fonctionnelles et structurales de ce facteur de demarrage de la synthese des proteines

par EVE DE COCK

Thèse de doctorat en Sciences biologiques fondamentales et appliquées. Sciences médicales

Sous la direction de Frédéric Dardel.

Soutenue en 1999

à Paris 6 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Le facteur de demarrage de la traduction if3 est une proteine specifique des eubacteries, essentielle a la viabilite cellulaire. Elle intervient dans la reconnaissance du codon de demarrage d'un gene par le ribosome et garantit la concentration en sous-unites 30s libres alors susceptibles d'interagir avec l'arn messager. Son role, dans la cascade d'evenements se produisant sur le complexe de demarrage de la traduction, est encore mal compris. Au cours de ce travail, nous nous sommes particulierement interesses au domaine c-terminal d'if3 qui est responsable de la fixation d'if3 sur la sous-unite 30s et au domaine de fixation de ce dernier dans l'arn 16s. Ainsi, nous avons mis en evidence que la region centrale de l'arn 16s (556-884) serait responsable de la fixation d'if3. Par rmn, nous avons observe que la face d'interaction d'if3c avec le domaine central de l'arn 16s etait constituee de l'helice 1 du brin 1 et de la boucle 130 (residus 130-139). Nous avons alors mis en evidence l'importance du residu d106 qui joue un role dans la specificite de l'interaction, cet acide amine serait un antideterminant. Pour comprendre le role d'if3 dans la fidelite du demarrage, nous avons etudie l'importance du peptide de connexion qui relie le domaine n-terminal au domaine c-terminal d'if3. Une approche combinant des etudes in vitro (biochimiques, biologie moleculaire), in vivo (tests de fonctionnalite) et structurales (rmn) a ete retenue. Nous avons montre que le domaine n-terminal ne pouvait pas assurer seul la fidelite du demarrage. Le peptide de connexion n'a, semble-t-il, pas de role a jouer dans la fonction d'if3 mais il garantit l'action concomitante des deux domaines de la proteine. La fixation des deux domaines d'if3 pourrait induire un changement de conformation dans la sous-unite 30s qui serait a l'origine de la discrimination par celle-ci des complexes ternaires de composition non canonique.


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  • Détails : 277 p.
  • Annexes : 121 ref.

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  • Consultable sur place dans l'établissement demandeur
  • Cote : T Paris 6 1999 118
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1999
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