Cartographie de restriction et composition genetique partielle du virus de la granulose (baculoviridae) de la teigne de la pomme de terre phthorimaea operculella (zeller)

par AHMED TAHA

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de GUY CROIZIER.

Soutenue en 1999

à l'ENSA MONTPELLIER .

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  • Résumé

    Ce memoire a pour objet la connaissance des genes composant le genome du virus de la granulose de la teigne de la pomme de terre phthorimaea operculella gv (phopgv) et se propose de situer ces informations dans le cadre general des baculovirus. La taille du genome de phopgv a ete estimee a 120. 5 kb. La carte de restriction basee sur sept enzymes a ete construite pour le genotype dominant present dans un isolat tunisien de phopgv datant de 1995. Plus du tiers du genome a ete sequence et 37 orf identifies. Trente trois orf correspondent a des genes deja decrits chez les baculovirus, 3 genes sont uniques et un orf codant pour un gene de mammifere (smc2p-like) n'a pas d'equivalent prealablement connu chez les baculovirus. Une conservation presque parfaite de l'ordre des genes entre le genome de phopgv et le seul genome de virus de granulose totalement sequence xestia c-nigrum gv (xcngv) est observee. Les positions des genes cap, lef 4, odv-e25, helicase 1 et lef 5 sont aussi conservees chez tous les genomes de gv et npv compares. L'analyse directe des regions contenant la granuline pour les virus de phopgv et du virus de la granulose de spodoptera littoralis gv (spligv) permet de repartir ces virus dans deux clades. Elle montre en outre que les genes directement en amont de la granuline sont peu conserves chez les gv alors que les deux genes situes en aval forment avec celui-ci un bloc de trois genes (granuline/polyedrine, orf 1629 equivalent et phosphokinase 1) conserve chez tous les baculovirus.

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  • Détails : 184 p.
  • Annexes : 255 ref.

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