Les elements transposables sine b2 fournissent un promoteur arn polymerase ii mobile

par OLIVIER FERRIGNO

Thèse de doctorat en Sciences biologiques fondamentales et appliquées

Sous la direction de Daniel Aberdam.

Soutenue en 1999

à Nice .


  • Résumé

    Les sine (short interspaced elements) sont des composants tres abondants des genomes de mammiferes qui se propagent par retrotransposition. Parmi les sine, la famille des elements b2 constitue approximativement 0,7% de l'adn genomique total de rongeur. Les b2, comme la plupart des sine ont evolue a partir d'un arn de transfert, mais possedent aussi une region unique, d'origine inconnue, de 70 pb a leur extremite 3. Nous avons localise un de ces membres dans un intron du gene lama3 qui code pour les isoformes de la chaine 3 de la laminine-5 murine. Nous avons identifie un nouveau transcrit 3 dont le site d'initiation est situe dans cette sequence b2 au niveau de la region unique et est derive du brin antisens au transcrit ressemblant aux arnt synthetises par la pol iii. Nos etudes ont montre tout d'abord que la nouvelle transcription in vivo par la pol ii du gene lama3 est conduite par un petit fragment de 70 pb appartenant exclusivement a la sequence b2 et est dirigee par un element initiateur et une boite tata en amont. Cette sequence initiatrice est reconnue par le facteur de transcription usf et l'expression ectopique de ce facteur peut stimuler fortement la transcription par la pol ii de l'element b2 in vivo. Ces resultats mettent en evidence pour la premiere fois la presence d'un promoteur pol ii dans un element sine. Nous avons ensuite elargi nos etudes en montrant que la grande majorite des elements b2 possedent un promoteur pol ii, et que ce promoteur possede des similitudes de sequences avec plusieurs promoteurs de genes codant pour des proteines. Ces donnees indiquent que les elements sine b2 ont le potentiel de distribuer un promoteur pol ii fonctionnel et regulable a travers le genome. Ceci a pu, au cours de l'evolution, resulter en la creation de nouveaux arnm qui fournissent le materiel de base pour la selection naturelle.


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Informations

  • Détails : 82 p.
  • Annexes : 353 ref.

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  • Bibliothèque : Université Nice Sophia Antipolis. Service commun de la documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 99NICE5357
  • Bibliothèque : Université Nice Sophia Antipolis. Service commun de la documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 99NICE5357bis
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