Diversité génétique du VIH-1 : impact sur le diagnostic moléculaire et la variabilité génétique intra-patient

par Karine Triques

Thèse de doctorat en Biologie. Santé

Sous la direction de Éric Delaporte.

Soutenue en 1999

à Montpellier 2 .


  • Résumé

    Le vih-1, caracterise par une importante diversite genetique, est subdivise en trois groupes m, n et o. Le groupe m, qui regroupe les principaux virus responsables de l'epidemie mondiale du sida, est compose de dix sous-types genetiquement differents (a a j), avec une repartition geographique tres heterogene, et une diversification considerable en afrique. L'analyse de plusieurs souches africaines, preliminairement classees dans le sous-type f, a revele une tres grande divergence au sein du sous-type f, caracterise dorenavant par deux sous-groupes f1 et f2. Cette etude a egalement permis de caracteriser un nouveau sous-type : le sous-type k (triques et al. , 1999a ; 1999b). Les consequences de la diversite genetique sur le diagnostic moleculaire et sur la progression de la maladie ont ete abordees. La diversite genetique du vih-1 diminue l'efficacite de certains tests de detection et de quantification de l'arn viral plasmatique de plusieurs souches, notamment les souches de sous-types a. La performance d'un nouveau test (version 1. 5 du test amplicor hiv-1 monitor) a ete verifiee sur plusieurs souches de sous-types a a g. Cette etude a permis de confirmer l'efficacite maximale de ce test (triques et al. , 1999c). Le sous-type genetique, soupconne egalement d'influencer la transmissibilite et la pathogenicite du virus, pourrait agir sur l'heterogeneite de la population virale au sein de l'individu infecte. Dans le cadre d'un suivi de cohorte de patients infectes par differents sous-types, aucune correlation n'a ete obtenue entre l'appartenance du virus a un sous-type et sa variabilite intra-patient, par contre une correlation entre le phenotype si des souches vih-1 et l'augmentation de l'heterogeneite de la population virale intra-patient a ete observee. Triques k et al. 1999a. Virology. 20 ; 259(1) : 99-109. Triques k et al. 1999b. Aids res. Hum. Retroviruses. Sous presse. Triques k et al. 1999c. J. Clin. Microbiol. 37(1) : 110-116.


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  • Détails : 188 f.
  • Annexes : Bibliogr.: f. 163-186

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  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TS 99.MON-129
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