Réponse des communautés bactériennes telluriques à un apport de mercure inorganique : influence de la localisation des bactéries

par Lionel Ranjard

Thèse de doctorat en Sciences

Sous la direction de Alain Chalamet.

Soutenue en 1999

à Lyon 1 .

Le jury était composé de Alain Chalamet.


  • Résumé

    Cette etude vise a l'evaluation de la reponse a court terme (30 jours) des communautes bacteriennes a un apport de mercure inorganique (hg(ii), 10 ppm) en fonction de leur localisation dans les microenvironnements d'un sol sablo-limoneux. Ces microenvironnements, obtenus par la combinaison entre une technique de lavages de sol et un fractionnement physique, sont le compartiment externe (macroporosite a l'exterieur des agregats), le compartiment interne (microporosite a l'interieur des agregats) et les differentes classes de tailles et de stabilites d'agregats du compartiment interne (fractions macroagregees, fractions microagregees, argiles dispersables). Des denombrements indirects effectues avant et apres l'apport de hg(ii), ont revele une absence d'effet sur le nombre de bacteries heterotrophes totales et une augmentation significative des phenotypes hg r (resistants au mercure). L'amplitude de cet enrichissement est variable entre les microenvironnements et est indicatrice de differences dans la biodisponibilite et la bioaccessibilite du mercure en fonction des caracteristiques physico-chimiques et structurales. Grace au developpement d'un fingerprint genetique (risa) nous avons mis en evidence des differences dans l'importance des modifications survenant dans la structure genetique des sous-communautes bacteriennes de chaque microenvironnement en reponse a l'apport de hg(ii). Les modifications observees au sein de la communaute du sol total resultent de celles qui sont observees dans les sous-communautes bacteriennes localisees dans le compartiment externe et dans la fraction argile dispersable. L'importance de ces modifications semble etre dependante de l'environnement poral et la teneur en colloides (matieres organiques et argiles) qui influencent la biodisponibilite du metal mais aussi de la structure populationnelle de la sous-communaute qui conditionne sa sensibilite au stress. En dernier, lieu nous avons demontre l'implication des determinants genetiques mer dans la reponse adaptative des sous-communautes au mercure associees aux differents microenvironnements. Cette reponse se manifeste par un enrichissement des bacteries hg r g- porteuses de ces genes et par l'implication preferentielle de certains types de determinants mer dans l'adaptation des communautes.


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Informations

  • Détails : 1 vol. (170 f.)
  • Annexes : Bibliogr. f. 143-170

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