Analyse de la distribution des effets des genes dans le cadre d'un modele metabolique de la variation quantitative

par BRUNO BOST

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de DOMINIQUE DE VIENNE.

Soutenue en 1999

à l'INAPG .

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  • Résumé

    L'objet de cette these est l'analyse des facteurs susceptibles d'affecter la distribution des effets des genes controlant la variation des caracteres quantitatifs (qtl). Le caractere choisi est un flux metabolique a travers une chaine lineaire constituee d'enzymes dont les caracteristiques sont determinees par des locus positionnes sur une carte genetique. Ce modele, issu des travaux de kacser et burns, decrit de facon mecaniste la relation entre les proprietes des produits des genes et la valeur du caractere, et implique la presence d'effets de dominance et d'epistasie. Il ressort des simulations, comme des calculs analytiques, que la distribution des effets des qtl dans une descendance f 2 presente necessairement une forme en l, avec plusieurs causes possibles : la repartition du controle metabolique entre les differentes enzymes chez les parents, le desequilibres de liaison entre les qtl, une faibles heritabiblite du caractere, ou une population analysee de taille reduite. De plus il apparait que l'estimation des effets des qtl (r 2) est peu robuste en presence de desequilibre de liaison ou pour une heritabilite faible, par rapport a un caractere additif. L'evolution d'un systeme metabolique dans une population panmictique de taille finie soumise a une selection directionnelle pour le flux et a la mutation se caracterise par un important fardeau genetique, en raison des effets de dominance et d'epistasie. A l'equilibre, la distribution des activites enzymatiques dans la population est principalement determinee par la distribution des effets des mutations sur l'activite. Ce travail theorique s'inscrit dans le contexte general de l'integration a la genetique quantitative des acquis de la physiologie, de la biochimie ou de la genetique moleculaire.


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  • Détails : 184 p.
  • Annexes : 323 ref.

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