Analyse genetique de la resistance du colza a la necrose du collet et a la cylindrosporiose a l'aide des marqueurs moleculaires

par MARIE-LAURE PILET

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de MICHEL RENARD.

Soutenue en 1999

à Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon .

mots clés

Résumé

La necrose du collet, causee par leptosphaeria maculans, est la maladie la plus preoccupante dans la plupart des pays producteurs de colza (brassica napus l. ). La cylindrosporiose, due a pyrenopeziza brassicae, est devenue une maladie importante en europe de l'ouest. L'objectif de ce travail est d'identifier et de comparer les facteurs genetiques de resistance a l. Maculans et a p. Brassicae chez le colza. Au stade adulte, la resistance quantitative de <single high-reversed-9 quotation mark>darmor<right single quotation mark> a ete analysee par recherche de qtl dans les croisements <single high-reversed-9 quotation mark>darmor-bzh<right single quotation mark> x <single high-reversed-9 quotation mark>yudal<right single quotation mark> (hd) et <single high-reversed-9 quotation mark>darmor<right single quotation mark> x <single high-reversed-9 quotation mark>samourai<right single quotation mark> (hd et f 2 : 3). La carte genetique <single high-reversed-9 quotation mark>darmor-bzh<right single quotation mark> x <single high-reversed-9 quotation mark>yudal<right single quotation mark> a ete transferee sur le croisement <single high-reversed-9 quotation mark>darmor<right single quotation mark> x <single high-reversed-9 quotation mark>samourai<right single quotation mark>, principalement avec des marqueurs rapd et rflp. Les 3 descendances ont ete evaluees au champ en 1995, 96 et 98 pour les resistances etudiees. Un total de 16 qtl de resistance a la necrose du collet a ete revele. Parmi ceux-ci, 4 etaient detectes sur 2 ou 3 annees et 3 dans les 2 croisements. Un total de 10 qtl de resistance a la cylindrosporiose a ete identifie dans la descendance <single high-reversed-9 quotation mark>darmor-bzh<right single quotation mark> x <single high-reversed-9 quotation mark>yudal<right single quotation mark>. Six d'entre eux etaient communs aux 2 annees. Seules 2 regions ont ete associees a la resistance aux 2 maladies, dont l'une correspond au gene de nanisme, <single high-reversed-9 quotation mark>bzh<right single quotation mark>. Au stade cotyledonaire, le marquage moleculaire de resistances specifiques a l. Maculans a ete effectue, par bsa, chez <single high-reversed-9 quotation mark>quinta<right single quotation mark> (gene rlm1), <single high-reversed-9 quotation mark>glacier<right single quotation mark> (gene rlm2) et <single high-reversed-9 quotation mark>tapidor<right single quotation mark> (genes rlm t a p 1 et rlm t a p 2). L'ensemble des genes, sauf rlm2, ont ete localises sur 2 groupes de la carte <single high-reversed-9 quotation mark>darmor-bzh<right single quotation mark> x <single high-reversed-9 quotation mark>yudal<right single quotation mark>. Une colocalisation entre rlm1, rlm t a p 1 et des qtl de resistance a la necrose du collet et a la cylindrosposiose a ete observee. A partir des qtl et genes identifies, une recherche de signification des facteurs de resistance a ete initiee, notamment par la strategie genes candidats. Deux schemas de selection assistee par marqueurs ont egalement ete elabores, utilisant 8 regions genomiques liees aux resistances etudiees.

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