I. Etude du modele transitionnel pour donnees longitudinales ii. Choix de modeles dans les bases de donnees cliniques

I. A study of the transitionnal model for longitudinal data ii. Model choice in clinical data-bases

• Auteur / Autrice : MELANIE FROUARD
• Direction : André Carlier
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences médicales
• Date : Soutenance en 1998
• Etablissement(s) : Toulouse 3

Résumé

Mes travaux ont pour origine un projet de recherche finance pour trois ans par les laboratoires pharmaceutiques pierre fabre, portant sur l'elaboration d'une methode d'identification de profils de patients. Les developpements pratiques nous ont amenes a considerer des problemes specifiques aux donnees de suivi clinique. En particulier, leur caractere longitudinal est a la base de nos investigations sur le plan theorique. Dans le cadre de la pharmacovigilance, nous sommes interesses a l'analyse de l'efficacite et de la tolerance d'un medicament. Nous avons cherche a mettre en evidence des profils de patients relatifs a un evenement particulier (efficacite du traitement, effet indesirable), les objectifs poursuivis etant les suivants: l'enrichissement du dictionnaire vidal, et le developpement d'une methode pronostic de detection des effets secondaires. Pour cela, nous avons mis en uvre un outil methodologique et informatique, utilisant l'information recueillie au cours de differentes experimentations effectuees sur le medicament, et stockee dans une base de donnees. Cet outil fait intervenir diverses techniques d'analyse : regression logistique, analyse discriminante, methodes automatiques de selection de variables. Il est adapte a la specificite des donnees : la rarete des phenomenes observes, la presence conjointe de variables qualitatives et quantitatives, le grand nombre de facteurs explicatifs, et l'heterogeneite des donnees due a la diversite des sources. Sur le plan theorique, nous nous interessons a l'aspect longitudinal des donnees. Nous modelisons les probabilites de transition d'une chaine de markov a l'aide d'un modele lineaire generalise. Dans ce cadre, nous montrons les resultats classiques de convergence de l'estimateur du maximum de vraisemblance. Les proprietes asymptotiques des tests d'hypotheses en decoulent naturellement. D'autres travaux portent sur l'analyse des residus definis de facon adequate dans le cas longitudinal, ainsi que sur la mesure de l'influence de chaque individu dans l'estimation des parametres. Des simulations ont ete effectuees pour appuyer certains des resultats theoriques obtenus, et l'application de ces mesures a des donnees reelles met en evidence leur utilite dans la pratique.