Caracterisation de partenaires fonctionnels de la proteine garlp de saccharomyces cerevisiae requise pour la maturation du pre-arn ribosomique

par Cécile Bousquet-antonelli

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Michèle Caizergues-Ferrer.

Soutenue en 1998

à Toulouse 3 .

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  • Résumé

    La biogenese des ribosomes eucaryotes met en jeu la synthese d'un long transcrit primaire appele pre-arnr. La molecule precurseur de l'arn ribosomique contient, outre les especes d'arnr matures, des sequences espaceurs qui sont excisees lors de coupures endo et exonucleolytiques. Les sequences d'arnr matures sont chimiquement modifiees durant ou immediatement apres la transcription du pre-arnr. Ces modifications sont principalement de deux types : des methylations en position 2'-o-ribose et des isomerisations de residus uridine en pseudouridine. Les cellules eucaryotes comportent un grand nombre de petits arn nucleolaires (snoarn) qui s'associent avec des proteines non ribosomiques sous forme de particules ribonucleoproteiques (snornp). La large majorite des snoarn peut etre repartie, sur la base de la conservation de motifs de sequence et de structure, en deux familles respectivement appelees famille des snoarn c/d et h/aca. Les snoarn c/d, tous associes avec une proteine nucleolaire phylogenetiquement tres conservee : la fibrillarine (nop 1p chez la levure), servent pour la plupart, de guides des methylation en position 2'-o-ribose. Nous avons montre que la proteine garlp de s. Cerevisiae requise pour la production de l'arnr 18s, est associee avec tous les snoarn h/aca et qu'elle est necessaire, a l'instar de nop 1p pour les methylations de ribose, a la pseudouridylation globale du pre-arnr. Ces resultats ont consitue le premier element tangible en faveur d'un role des snoarn h/aca dans la pseudouridylation. Peu de temps apres, l'equipe du dr. T. Kiss (lbme toulouse) a prouve que la majorite des snoarn h/aca remplit un role de guide de pseudouridylation. Nous avons ensuite etudie la proteine nucleolaire cbf5p qui presente les domaines consensus des pseudouridine synthases. Cette proteine est non seulement requise, de la meme maniere que garlp, pour la production de l'arnr 18s mais aussi pour la pseudouridylation globale du pre-arnr. Cependant nous ne pouvons affirmer qu'elle presente une activite pseudouridine synthase effective dans la mesure ou elle est indispensable a la stabilite des snoarn h/aca et de garlp. Nous avons isole, lors de la recherche de partenaires physiques de garlp, une nouvelle proteine nucleolaire nhp2p qui est tres certainement un nouveau constituant specifique de toutes les snornp h/aca. L'arn helicase potentielle roklp, que nous avons identifiee en tant que partenaire fonctionnel de garlp et de snr10 (snoarn h/aca guide de pseudoridylation et necessaire a la production de l'arnr 18s), est nucleolaire et impliquee dans la production de la grande sous-unite du ribosome. Il est probable qu'elle intervienne dans la formation et/ou la dissociation des duplex snoarn h/aca/pre-arnr formes pour l'isomerisation des uridines en pseudouridine.


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Informations

  • Détails : 137 P.
  • Annexes : 250 REF.

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  • Bibliothèque : Université Paul Sabatier. Bibliothèque universitaire de sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 1998TOU30058
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