Transport du fer chez les bacteries fixatrices d'azote : structure tridimensionnelle en solution des pyoverdines de pseudomonas putida g4r. synthese d'analogues photoactivables de siderophores

par ABDEL LATIF MOHAMED SALAH EL DIN

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Mohamed Abdallah.

Soutenue en 1998

à Strasbourg 1 .

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  • Résumé

    Parmi les pseudomonas fluorescent, pseudomonas putida g4r excrete en milieu carence en fer deux pyoverdines, la pyoverdine g4r et la pyoverdine g4r a. Leur structure primaire a ete etablie par spectrometrie de masse en mode fab et confirmee par spectrometrie de masse en tandem (ms/ms) et par rmn 1d te 2d des noyaux #1#5n, #1#3c et #1h effectuees sur la pyoverdine non marquee ainsi la pyoverdine marquee a l'azote #1#5n. Ces deux pyoverdines possedent un chromophore derive de la diamino-2,3 dihydroxy-6,7 quinoline, lie a un heptapeptide lineaire suivant : (l)-asp-(l)-orn-(d)--threo-ohasp-(l)-dab-gly-(l)-ser-(l)-cyclo-ohorn au milieu de laquelle se trouve un deuxieme groupe tetrahydropyrimidine. Celui-ci fait partie d'un nouvel acide amine qui resulte de la condensation d'acide -hydroxyaspartique et d'acide diamino-2,4 butyrique (ohasp-cthpmd). La structure tridimensionnelle en solution du complexe de gallium de la pyoverdine g4r a ete determinee par rmn 1h cosy, hohaha, noesy et roesy a deux temperatures differents 283 k et 303 k. La chaine peptidique est plus rigide et tres proche du chromophore. Le complexe est tres compacte et les sites de coordination du metal situes a la surface de la molecule. La configuration du complexe autour du metal etablie par rmn et confirmee par dichroisme circulaire est. Le metal peut etre facilement libere sans necessiter de changement conformationnels particuliers. Les groupes polaires de la chaine peptidique responsable de la reconnaissance avec le recepteur membranaire, se trouvent a une autre extremite de la molecule. L'azidobenzoylferricrocine, analogue photoactivable du ferrichrome et de la ferricrocine, apres avoir mis au point les conditions de synthese sur une molecule modele derivee de la serine. Ce siderophore photoactivable est a la base d'une etude par marquage de photoaffinite de la proteine fhua et du systeme de transport de fer ferrichrome-dependant chez escherichia coli. Il devra permettre de mieux connaitre les interactions entre la ferricrocine et sa proteine membranaire receptrice fhua.


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Informations

  • Détails : 176 P.
  • Annexes : 199 REF.

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  • Bibliothèque : Université de Strasbourg. Service commun de la documentation. Bibliothèque Blaise Pascal.
  • Disponible pour le PEB
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