Etude des proprietes statiques et dynamiques de longues chaines d'adn sur deux exemples : rheologie de solutions semi-diluees et cyclisation d'une chaine globulaire

par DOROTHEE JARY

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de JEAN LOUIS SIKORAY.

Soutenue en 1998

à Paris 11 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Nous avons etudie les proprietes dynamiques de longues chaines d'adn dans le but de mieux comprendre leur comportement intracellulaire. Nous avons tout d'abord etudie les proprietes de solutions semi-diluees d'adn de bacteriophage t4. A faible gradient de cisaillement, la solution a un comportement newtonien. Les variations de la viscosite et du temps de reptation en fonction de la concentration sont identiques a celles obtenues avec des polymeres synthetiques. Pour des gradients de cisaillement eleves, la solution a des proprietes viscoelastiques non lineaires. Pour la concentration d'adn la plus elevee, la contrainte presente un plateau sur deux decades de gradient de cisaillement. Les adn topoisomerases sont des enzymes qui permettent de resoudre les problemes topologiques des molecules d'adn lors du cycle cellulaire. Un modele prevoit une modification du comportement dynamique de longues chaines d'adn lineaires en presence de ces enzymes. Nous avons tente de verifier les predictions du modele mais nos experiences ne permettent pas de conclure. Dans une seconde partie, nous avons etudie l'influence de la conformation de la chaine d'adn sur la reaction de cyclisation. Nous avons tout d'abord propose un diagramme decrivant la conformation de la chaine en fonction de la concentration en ions monovalents et en spermidine. L'etude de la reaction de cyclisation a ensuite montre des differences importantes lorsque la chaine passe de la conformation pelote a la conformation de globule : la cinetique est acceleree par un facteur 10#6, l'energie d'activation est diminuee par un facteur 3, les variations d'enthalpie et d'entropie sont plus importantes, la concentration effective est augmentee d'un facteur 9. 10#4. Enfin, nous avons etudie la region dans laquelle la reaction de cyclisation est la plus rapide (cyclisation en une seconde). La zone de maximum de cyclisation en une seconde semble correspondre a l'arrangement le plus dense possible de l'adn dans le globule.

  • Titre traduit

    Study of static and dynamical properties of long dna chains on two examples : rheology of semi dilute solutions and cyclization of a globular chain


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Informations

  • Détails : 189 P.
  • Annexes : 88 REF.

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  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Orsay, Essonne). Service Commun de la Documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH2014-013924
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