Etude de la regulation transcriptionnelle du metabolisme anaerobie de la carnitine chez escherichia coli.

par ANNE BUCHET

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de MARIE-ANDREE MANDRAND BERTHELOT.

Soutenue en 1998

à Paris 7 .

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  • Résumé

    Escherichia coli est capable d'assurer sa croissance anaerobie en utilisant divers accepteurs exogenes d'electrons. La crotonobetaine, derivee de la l-carnitine ubiquitaire, pourrait jouer ce role lors de sa transformation en gamma-butyrobetaine. La voie metabolique correspondante, inductible par la carnitine, est codee par les operons divergents caitabcde et fixabcx. Le gene caif identifie en 3 de l'operon cai, et transcrit en sens inverse en anaerobiose, code une proteine de 15 kda dont la surproduction entraine une stimulation de l'expression des operons cai et fix en reponse a la carnitine. Un role d'activateur transcriptionnel specifique a donc ete propose pour caif. L'expression des operons cai et fix repond aux memes stimuli et aux memes regulateurs generaux. Ces controles s'exercent directement ou par le gene regulateur caif. La repression par l'oxygene s'effectue via la proteine fnr qui active la transcription de caif. La proteine crp se fixe a la fois sur le promoteur de caif et sur trois sites dans la region intergenique cai-fix. Elle pourrait jouer le role d'activateur direct dans la transcription des operons cai et fix sigma 70-dependants. La proteine caif purifiee se fixe sur une sequence inversee repetee centree a 70 et 127 de fix et chevauchant deux sites crp. La fixation simultanee de crp et caif est cooperative et indispensable au positionnement de l'arn polymerase sur les promoteurs cai-fix, expliquant la dependance stricte de leur transcription vis-a-vis des deux activateurs. Dans un milieu minimum supplemente en lactate et en carnitine, la restauration de la croissance anaerobie de souches mutantes par le locus cai-fix confirme le role physiologique propose.

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Informations

  • Détails : 254 p.
  • Annexes : 137 ref.

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  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • Accessible pour le PEB
  • Cote : TS1998
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