Caracterisation du gene ozf, de son promoteur et des sequences cibles de la proteine, et identification d'un nouveau gene, occ-1, surexprime dans des tumeurs du colon

par LAURENCE PIBOUIN

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de GERARD GOUBIN.

Soutenue en 1998

à Paris 6 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Les travaux presentes concernent l'etude de deux genes humains isoles au laboratoire, ozf (only zinc fingers) et occ-1 (overexpressed in colorectal carcinomas), respectivement surexprimes dans des cancers du pancreas exocrine et du colon, et qui pourraient participer a l'initiation ou a la progression tumorale. Le gene ozf est localise sur le chromosome 19 en 19q13. 1. Son expression est restreinte a certains tissus ou types cellulaires. Il est amplifie dans 15 a 25% des lignees cellulaires et tumeurs du pancreas exocrine analysees, et surexprime en arn messagers et en proteines dans plus de la moitie des cas. La proteine ozf, constituee uniquement de dix motifs doigt a zinc de type c2h2, possede les caracteristiques structurales et biochimiques des proteines de la famille kruppel, dont plusieurs membres sont impliques dans la regulation de la transcription. Deux approches ont ete developpees pour aborder la fonction de ce facteur de transcription potentiel : la recherche du promoteur du gene, et l'identification du ou des motifs nucleotidiques reconnus par la proteine ozf. Le gene ozf est compose d'au moins cinq exons repartis sur 25 kb, et l'un des quatre exons 5 non codants est soumis a epissage alternatif. La region de 1 kb situee en amont du premier exon possede les caracteristiques des regions promotrices, et permet la transcription d'un gene rapporteur en transfection transitoire. L'etude de la regulation transcriptionnelle du gene permettra d'aborder les mecanismes responsables de sa surexpression dans des cellules tumorales. Nous avons mis au point une technique de selection de fragments d'adn ayant de l'affinite pour la proteine ozf. Celle-ci nous a permis d'identifier le motif ttcgtttcccctct qui interagit specifiquement avec la proteine, et d'isoler 14 fragments d'adn genomiques reconnus par la proteine ozf. Trois d'entre eux contiennent une sequence proche du motif precedent. Les genes associes a ces fragments, susceptibles d'etre regules par la proteine ozf, seront caracterises. Le second gene, occ-1, a ete isole par criblage differentiel a partir d'un couple tumeur colique-tissu sain. Ce gene, qui est transcrit en deux arn messagers, est surexprime dans 25% des tumeurs coliques analysees. Il est localise sur le chromosome 12, en 12p24. 1, et presente une specificite tissulaire. Deux adnc correspondant aux deux transcrits du gene, ont ete clones. Ces deux adnc possedent differents cadres de lecture, codant pour des proteines putatives de masses moleculaires inferieures a 10 kda, et plusieurs d'entre eux ont ete traduits in vitro. La production d'anticorps diriges contre ces proteines putatives nous permettra d'identifier celles synthetisees dans la cellule, et d'aborder leur etude fonctionnelle. La caracterisation de la fonction des genes ozf et occ-1 devrait nous aider a definir leur implication dans la cancerogenese.


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Informations

  • Détails : 190 p.
  • Annexes : 259 ref.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Disponible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1998
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