Auto-stop en liaison aux inversions chromosomiques chez drosophila melanogaster

par Frantz Depaulis

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Michel Veuille.

Soutenue en 1998

à Paris 6 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Quand une mutation avantageuse se fixe dans une population, le polymorphisme des locus voisins est reduit et n'est plus distribue de facon neutre dans la population. Cet effet d'auto-stop est d'autant plus etendu que le taux de recombinaison est faible. Les inversions chromosomiques inhibent la recombinaison et constituent un bon systeme de detection de l'auto-stop. Le polymorphisme nucleotidique d'une population de drosophila melanogaster, polymorphe pour l'inversion in(2l)t, est etudie sur differents genes situes a distance croissante de l'inversion : vha 681, adh, et su(h) a l'exterieur de l'inversion et le locus fbp2 a l'interieur de celle-ci. Une sequence de reference de d. Simulans est utilisee a chaque locus pour estimer le taux de mutation des genes. La variabilite s'ecarte de la neutralite sur tous les locus, mais le sens de la deviation differe selon le gene. Le marqueur le plus proche de l'inversion - vha 681 - presente les caracteristiques d'un evenement d'auto-stop en liaison totale avec le site selectionne : sites polymorphes peu nombreux avec chacun un variant rare associe a l'un des arrangements. Plus loin de l'inversion, le locus su(h) montre une variabilite importante, mais structuree en quelques haplotypes associes au polymorphisme chromosomique, suggerant un effet d'auto-stop en liaison partielle avec le site selectionne. Au milieu de l'inversion, le locus fbp2 est le plus eloigne du pied de celle-ci. Il montre egalement une structuration haplotypique significative, mais alteree par la recombinaison et non associee au polymorphisme d'inversion. Deux nouveaux tests de neutralite, fondes sur le nombre d'haplotypes (k) et la diversite haplotypique (h), sont proposes pour detecter des structurations haplotypiques singulieres, telles que celles engendrees par l'auto-stop. Ces statistiques s'averent informatives avec des parametres biologiques realistes, et conduisent a des tests significatifs sur les donnees de su(h). Enfin, une etude de polymorphisme de restriction interpopulations au locus adh, situe a proximite de su(h), suggere que les evenements selectifs puissent favoriser la propagation rapide d'un variant dans l'espece et reduire la differenciation geographique. Ces resultats suggerent des effets d'auto-stop frequents, ou (et) d'etendue accrue associes aux inversions.


  • Pas de résumé disponible.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe sous forme papier

Informations

  • Détails : 233 P.
  • Annexes : 292 REF.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Disponible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1998
Voir dans le Sudoc, catalogue collectif des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche.