Mc1, une proteine structurale d'archaebacterie : proprietes de fixation sur l'adn

par CARINE PARADINAS

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Françoise Culard.

Soutenue en 1998

à Orléans .

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  • Résumé

    Mc1, une proteine structurale d'archaebacterie : proprietes de fixation sur l'adn. Les archaebacteries, comme l'ensemble des organismes vivants, possedent des proteines qui assurent l'organisation de leur adn. Ces proteines ont des caracteristiques similaires (petite taille, caractere basique, abondance et forte affinite pour l'adn), mais leur structure et leur mode de fixation sur l'adn sont tres divers. Ainsi, certaines d'entre elles ressemblent a la proteine hu d'e. Coli alors que d'autres sont proches des histones des eucaryotes. La proteine mc1, issue d'une famille d'archaebacteries methanogenes, ne presente, quant a elle, aucune homologie de sequence avec les autres proteines chromosomiques connues, mais partage la capacite a courber fortement l'adn. La plupart de ces proteines interviennent au cours de differents processus cellulaires en reconnaissant certaines structures ou sequences de l'adn. Pour comprendre le mode de fixation de mc1 sur l'adn ainsi que ses fonctions cellulaires, nous avons etudie in vitro l'interaction de la proteine avec l'adn par les methodes de gel retard et d'empreinte chimique. Nous avons montre que mc1 se fixe preferentiellement sur des structures d'adn a quatre branches independamment de la presence de cations et de la sequence de l'adn. La fixation s'effectue au centre de la jonction et entraine une modification conformationnelle de l'adn. Mc1 reconnait egalement de facon preferentielle des jonctions d'adn a trois branches mais de facon surprenante, presente une tres faible affinite pour les bulges. Ainsi, mc1 reconnait selectivement certaines pliures de l'axe de la double helice. Nous avons egalement montre que la proteine mc1 presente une plus forte affinite pour certaines sequences de l'adn. Malgre l'absence d'une sequence consensus, il apparait que la presence d'une serie d'adenines et/ou thymines ainsi que celle de dinucleotides flexibles contribuent a augmenter l'affinite de mc1 pour l'adn. L'utilisation de sondes chimiques (kmno#4, depc) a mis en evidence un important changement conformationnel de l'adn localise au niveau du site de fixation de mc1. L'ensemble de ces resultats montre l'importance de la structure et de la flexibilite de la double helice dans le processus de reconnaissance de l'adn par mc1.


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  • Détails : 145 P.
  • Annexes : 229 REF.

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