Etude de la régulation transcriptionnelle de différents gènes impliqués dans le métabolisme des sucres chez Escherichia coli

par Jean-François Prost

Thèse de doctorat en Sciences. Biochimie

Sous la direction de Alain-Jean Cozzone.

Soutenue en 1998

à Lyon 1 .

Le président du jury était Alain-Jean Cozzone.


  • Résumé

    Le travail presente dans cette these s'inscrit dans le cadre generale de l'etude de l'expression des genes chez escherichia coli. Plus particulierement, nous nous sommes interesses a l'activation de differents genes/operons impliques dans le metabolisme des sucres, en reponse a une modification chimique de l'environnement. Dans un premier temps, la region promoteur/operateur de different genes tels que icd (codant l'isocitrate deshydrogenase) ou ppsa (codant la phosphoenolpyruvate synthase) a ete caracterise afin d'identifier le site d'initiation de la transcription (+1) ainsi que le module de fixation de la rna polymerase. Des experiences de transcriptions in vitro ont ete realises pour identifier les differents facteurs impliques dans l'activation de ces genes. Ce travail a permis de mettre en evidence differents mecanismes moleculaires lies a la stimulation de l'initiation de la transcription chez e. Coli, tels que l'activation (i) dependante de l'element up de l'operon ace (codant les enzymes du cycle glyoxylique) (ii) ou dependante de la proteines cra (catabolic repressor activator) au niveau des genes icd et ppsa. Dans un deuxieme temps, des experiences de transcriptions in vitro realisees en presence de differents mutants ponctuels de l'extremite c-terminale de la sous-unite a de la rna polymerase ont revele le role fondamental joue par ce domaine au niveau de l'activation cra-dependante et element up-dependante des differents promoteurs etudies. Ce travail, realise en collaboration avec le pr. Ishihama (japon, mishima), suggere qu'un domaine constitue d'une helice a et d'un coude constitue une region cible capable d'interagir avec le dna. Il apparait que cette interaction est a l'origine de l'augmentation de l'affinite de la rna polymerase pour son dna operateur, a l'origine de la stabilisation du complexe ferme d'initiation de la transcription.


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  • Détails : 1 vol. (178 f.)
  • Annexes : Bibliogr. f. 146-177

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