Contribution methodologique et experimentale a l'etude de la selection assistee par marqueurs. Application au mais

par LAURENCE MOREAU

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de André Gallais.

Soutenue en 1998

à l'INA .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    L'utilisation des marqueurs moleculaires permet de predire les valeurs genetiques en combinant l'information qu'ils apportent aux donnees phenotypiques. L'objectif de ce travail est d'evaluer l'efficacite de cette strategie au cours du premier cycle de selection par une approche analytique et experimentale, appliquee a la selection du mais. Une etude analytique a ete developpee a partir d'un modele genetique simple prenant en compte l'effet de la taille de la population, qui joue un role primordial sur la puissance de detection des qtl et sur l'efficacite de la sam. La sam apparait plus efficace que la selection phenotypique pour des caracteres peu heritables, mais il existe une heritabilite optimale en dessous de laquelle la puissance de detection devient trop faible. Ce manque de puissance peut etre en partie compense par une augmentation du seuil de detection. Cette approche analytique a permis de comparer l'efficacite de la sam et de la selection phenotypique en raisonnant a cout constant. Une population de 300 familles f4 a ete evaluee en test dans 20 essais et caracterisee pour 93 locus rflp. La population a ete selectionnee selon un index rendement-humidite en utilisant trois methodes de prediction : phenotypique, sur marqueurs seuls ou combinant ces deux types d'information. Le prise en compte des heterogeneites de terrain au sein des essais permet un gain de precision, y compris lorsque les marqueurs sont utilises comme predicteurs. L'heritabilite des caracteres etant forte au niveau du dispositif, la selection combinee n'apparait pas significativement meilleure que les deux autres. Cependant l'utilisation des marqueurs augmente la precision des predictions et permet de faire moins d'essais.


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  • Détails : 172 P.
  • Annexes : 180 REF.

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