Analyse de la variabilite genetique de sequences microsatellites trinucleotidiques chez arabidopsis thaliana

par KARINE LORIDON

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de GEORGES PICARD.

Soutenue en 1998

à Clermont Ferrand 2 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Les microsatellites sont de petites sequences repetees en tandem presentes en un grand nombre de loci dans les genomes eucaryotes. Ils se caracterisent par une hypervariabilite de taille due a des variations de leur nombre de repetitions. Notre analyse porte sur la variabilite genetique des microsatellites trinucleotidiques chez la plante modele arabidopsis thaliana. L'amplification pcr de 12 loci microsatellites a ete realisee pour 49 ecotypes d'arabidopsis thaliana. Ces microsatellites presentent un niveau de polymorphisme intraspecifique modere, avec un nombre moyen d'alleles par locus egal a 4 (chaque locus possede entre 1 et 8 alleles) et un indice moyen de diversite genetique de 0,43. Le sequencage de nombreux alleles montre que 1) pour la plupart des loci microsatellites, les ecarts de taille entre alleles sont bien dus a des variations du nombre de repetitions trinucleotidiques, 2) pour les loci microsatellites imparfaits et composes formes de 2 blocs de triplets, les variations interalleliques affectent preferentiellement le bloc repete le plus long. Nos resultats font apparaitre une correlation entre le nombre moyen de repetitions et le nombre d'alleles observes pour un meme locus microsatellite. L'analyse de plantes individuelles revele une heterogeneite a l'interieur de certains ecotypes. Six ecotypes sont composes de 2 a 3 lignees. Les plantes heterozygotes observees dans 2 autres ecotypes temoignent vraisemblablement de croisements recents. Ces observations montrent qu'arabidopsis thaliana n'est pas une espece strictement autogame. Par ailleurs, les microsatellites trinucleotidiques apparaissent tres stables sur quelques generations ainsi que dans certaines situations de stress (regeneration, choc thermique).


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  • Détails : 173 P.
  • Annexes : 403 REF.

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  • Bibliothèque : Bibliothèque Clermont Université (Aubière). Section Sciences et Techniques.
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