Variabilité phénotypique et génétique chez Marasmius quercophilus, basidiomycète colonisant une litière de chêne vert

par Anne-Marie Farnet

Thèse de doctorat en Microbiologie

Sous la direction de Jean Le Petit.

Soutenue en 1998

à Aix-Marseille 3 .


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  • Résumé

    Cette etude constitue une premiere approche de la taxonomie de marasmius quercophilus, basidiomycete de la litiere du chene vert (quercus ilex l. ), en utilisant des criteres phenotypiques et genotypiques. Dans l'analyse phenotypique, les 36 souches recoltees sur le site de la gardiole de rians (var, france) ont ete regroupees en 11 phenons apres traitements statistiques (dendrogramme et analyse factorielle de correspondence). La nature du substratum (feuille de chene vert ou blanc, gland, bois) et la saison de recolte n'ont pas influence leur repartition. L'analyse genetique a mis en evidence une homogeneite importante au sein de cette collection. En effet, l'indice de similarite minimum obtenu a partir des donnees rapd etait de 0,71. De meme l'etude des fragments its (internal transcribed spacer) a revele des sequences identiques. L'organisation de ce genome a egalement pu etre determinee en microscopie photonique : le nombre chromosomique de base est egal a 5 (n = 5). D'autre part, cette etude a permis de decrire les potentialites enzymatiques de ce champignon de la pourriture blanche et donc son implication dans la degradation de la litiere. L'ensemble des tests enzymatiques ont demontre l'importance de son role dans cet ecosysteme puisque toutes les souches pouvaient degrader des polymeres presents chez les vegetaux : pectine, amidon, cellulose ainsi qu'un modele de lignine, l'indulin at. Dans ce dernier cas, seule la laccase (phenoloxydase a cuivre) etait impliquee dans le processus de degradation. Les essais d'induction par des composes aromatiques de cette enzyme chez m. Quercophilus ont revele la presence d'une enzyme constitutive et de trois formes induites selon le compose utilise (alcools veratrylique et coniferylique, acides p-hydroxybenzoique, vanillique et ferulique). L'alcool coniferylique s'est revele etre l'inducteur le plus efficace et la presence de cuivre dans le milieu de culture permettait egalement d'augmenter l'activite laccase.

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Informations

  • Détails : 110 p.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université d'Aix-Marseille (Marseille. Saint-Jérôme). Service commun de la documentation. Bibliothèque de sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : T 2595/A-B
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