Valorisation de plans de croisements pour la recherche de qtl chez les arbres forestiers ; exemple d'un diallele merisier

Use of mating designs for qtl search in forest trees ; example of a wild cherry diallel

• Auteur / Autrice : Hélène Muranty
• Direction : Bruno Goffinet
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1997
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

Dans ce travail, la valorisation des plans de croisements pour la recherche de qtl chez les arbres forestiers est etudiee puis appliquee a la definition d'un plan d'experience de recherche de qtl chez le merisier. L'analyse de la variabilite phenotypique dans un plan de croisement diallele chez le merisier montre que la selection sur tests clonaux des clones installes en vergers a graines et des parents des futures generations d'amelioration devrait donner de bons resultats. Les puissances de detection de qtl sont comparees pour des populations obtenues par divers plans de croisements. Les resultats montrent que pour echantillonner correctement la variance a un qtl additif, il faut utiliser une population issue de 4 a 6 parents au minimum, mais obtenue selon n'importe quel plan de croisements. L'interet et la mise en pratique du marquage des extremes dans une population comprenant plusieurs familles sont examines. L'efficacite du marquage des extremes est etudiee pour la detection de qtl affectant le caractere pour lequel les individus extremes sont marques ou un autre caractere. Une methode simple d'analyse des donnees est developpee pour bien prendre en compte la particularite des donnees obtenues par marquage des extremes. En consequence de ces resultats, un plan d'experience pour la recherche de qtl de resistance a l'anthracnose chez le merisier comprenant des descendances issues de 5 parents formant un plan de croisements diallele a ete choisi et les individus extremes de ces descendances seront marques. Finalement, les problemes statistiques lies a la mise en pratique de la selection assistee par marqueurs (sam) chez les arbres forestiers ont ete etudies et l'efficacite economique de la sam a ete evaluee dans le cadre de la selection de clones au sein de familles de pleins-freres. La sam dans ce cadre peut etre plus efficace que la selection phenotypique a moyens egaux, d'autant plus que la population d'amelioration est de taille importante.