Etude systematique du chromosome de bacillus subtilis

par PETAR PUJIC

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Stanislav Dusko Ehrlich.

Soutenue en 1997

à Paris 7 .

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  • Résumé

    Cette these a ete realisee dans le cadre du projet europeen du sequencage et de l'analyse fonctionnelle du chromosome de b. Subtilis. Une partie du chromosome de b. Subtilis situe entre les marqueurs kdg et le site d'attachement du prophage sp a ete sequence en utilisant une nouvelle strategie de sequencage basee sur l'amplification d'adn en chaine a haute fidelite (lr pcr). La determination et l'analyse de la sequence nucleotidique de cette region ont permis de reveler la presence de 38 cadres du lecture ouverte (orfs) dont 19 sans fonction attribuee. Une carte de transcription de la region situee entre les marqueurs sera et kdg (92 kpb) a ete etablie dans differentes conditions de culture. Des experiences d'hybridation en northern avec des sondes recouvrant cette region ont permis de detecter les profils de transcription de cette region. Les transcrits sont correles avec les phases vegetative, stationnaire ou de sporulation. Ce type d'etude associe a des analyses genetiques et biochimiques devrait aider a l'identification des fonction des 40% d'orfs inconnus de b. Subtilis. Ils ont aussi permis de preciser l'organisation structurale et transcriptionnelle de la region sera -kdg du chromosome de b. Subtilis. Certains operons ont ete etudies plus precisement : l'operon resabcde contenant des genes qui peuvent etre impliques dans la biogenese du cytochrome c. Cet operon est regule positivement par resd (regulateur global), qui regule aussi la transcription les autres genes impliquees dans la biogenese de cytochromes a et bf (genes ctaa et petcbd). L'etude de l'operon kdgrkat a montree qu'il code pour un regulateur : kdgr, une kinase : kdgk, une aldolase : kdga, et un transporteur kdgt. Les quatres genes sont impliques dans le metabolisme du d-galacturonate chez b. Subtilis. L'operon peut etre induit par la pectine, le polygalacturonate, le galacturonate, le tagaturonate, le glucuronate et le fructuronate.


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Informations

  • Détails : 195 P.
  • Annexes : 326 REF.

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  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • Accessible pour le PEB
  • Cote : TS1997
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