Etude theorique et experimentale de la dynamique des proteines : mouvements correles, mouvements fonctionnels

par STEPHANIE HERY

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Pierre Turq.

Soutenue en 1997

à Paris 6 .

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  • Résumé

    Les proteines sont parmi les composants les plus essentiels des organismes vivants. Elles contribuent a la structuration des organismes et executent la plupart des taches requises pour leur bon fonctionnement. Il est maintenant bien etabli que les proprietes et les activites biologiques des proteines sont intimement liees a leur structure tridimensionnelle mais egalement a leur mobilite intramoleculaire. Le travail de cette these fut principalement oriente vers la mise en evidence et la caracterisation, par simulation et/ou experiences, des mouvements impliques dans un certain nombre de proteines et plus specifiquement des enzymes. Le premier systeme etudie est une enzyme, le lysozyme, non pas pour ses proprietes biochimiques particulieres, mais comme modele pour la dynamique des proteines. Nous avons entrepris l'etude des mouvements correles, et plus particulierement les mouvements de corps rigides, du lysozyme a partir d'une simulation de la maille cristalline sur 1 ns. Nous avons utilise pour cela une nouvelle approche combinant l'extraction de groupes rigides avec des calculs de correlations et l'analyse de la diffusion diffuse calculee et experimentale. Parallelement a cela, des experiences de diffusion elastique des neutrons ont ete realisees de maniere a completer les informations concernant la relation existant entre l'activite enzymatique et la dynamique interne dans les proteines. Il existe en effet de nombreux exemples qui montrent que les mouvements internes des proteines sont determinants dans les mecanismes biochimiques, et que durant ces derniers, leur structure fluctue et adopte une serie de conformations successives. L'etude de l'intensite de diffusion elastique sur differents echantillons nous a permis de mettre en evidence l'amplitude et l'echelle de temps de certains mouvements impliques, leur correlation a l'activite enzymatique, ainsi que l'influence du solvant.


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Informations

  • Détails : 205 P.
  • Annexes : 107 REF.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Disponible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1997
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