Rôle d'une fonction microbienne dans l'écologie des micro-organismes du sol : valeur sélective des gènes de la dénitrification

par Laurent Philippot

Thèse de doctorat en Sciences

Sous la direction de Robert Lensi.

Soutenue en 1997

à Lyon 1 .

Le jury était composé de Robert Lensi.


  • Résumé

    La denitrification est un processus respiratoire microbien qui permet le transfert de l'azote present sous forme soluble dans la biosphere vers l'atmosphere. Parmi les differents aspects concernant l'etude de ce processus de denitrification, nous nous sommes interesses aux mecanismes influencant la distribution des micro-organismes responsables de cette activite dans le sol. Dans ce cadre, notre objectif a ete d'etudier le role du processus de denitrification dans l'ecologie des bacteries. A partir de l'etude de la communaute denitrifiante indigene du sol, nous avons pu observer que les bacteries denitrifiantes etaient favorisees par rapport aux heterotrophes dans le gradient physico-chimique du sol genere par les racines des plantes. Nous n'avons par contre pu mettre en evidence un tel avantage competitif des denitrifiants dans le gradient physico-chimique present dans les agregats de sol. En utilisant des mutants isogeniques, nous avons montre que la possession de la nitrite reductase pouvait conferer un avantage competitif significatif aux denitrifiants. Nous avons ainsi mis en evidence cet avantage competitif des bacteries capable de reduire le nitrite pour la colonisation d'environnements anaerobies, de la rhizosphere des plantes mais aussi pour la colonisation de la zone interne des agregats. Pour elargir notre travail nous nous proposons d'evaluer le role des autres etapes de la denitrification dans l'ecologie des micro-organismes du sol. La premiere etape a donc consiste a construire un vecteur permettant d'obtenir des mutants incapables de reduire le nitrate. Pour cela nous avons du cloner et sequencer les genes de la nitrate reductase. Apres l'obtention du mutant, la prochaine etape de notre travail consistera, en se basant sur des etudes proches de celles effectuees avec les mutants sur le gene de la nitrite reductase, a evaluer la valeur selective du gene codant pour la nitrate reductase.

  • Titre traduit

    Role of a microbial function in the ecology of microorganisms in soil : selective value of the denitrifying genes


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  • Détails : 1 vol. (132 f.)
  • Annexes : Bibliogr. f. 97-116 et notes bibliographiques dans chaque article

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  • Bibliothèque : Université Claude Bernard (Villeurbanne, Rhône). Service commun de la documentation. BU Sciences.
  • Disponible pour le PEB
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