Cartographie physique et genetique du genome de clostridium acetobutylicum atcc824

par Emmanuel Cornillot

Thèse de doctorat en Biologie et génétique moléculaire et cellulaire - Biotechnologie

Sous la direction de Philippe Soucaille.

Soutenue en 1997

à Toulouse, INSA .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Les experiences qui ont conduit a la constitution de la carte physique et genetique du genome de clostridium acetobutylicum atcc824 sont decrites dans ce memoire. Ces travaux ont tout d'abord permis de demontrer la localisation episomique des genes de la solvantogenese. Un plasmide de 210 kpb, present dans toutes les souches de l'espece c. Acetobutylicum, a ete caracterise. Ce plasmide a ete appele psol1 dans la souche atcc824 car il porte les genes codant pour les enzymes des etapes finales du metabolisme menant a la production d'acetone et de butanol. L'auteur apporte la preuve que la perte de psol1 est associee au processus de degenerescence chez c. Acetobutylicum. Le plasmide psol1 est un plasmide de speciation car les souches degenerees ne produisent plus de solvants et ne sporulent plus. Les cartes physique et genetique du chromosome de c. Acetobutylicum atcc824 ont ete etablies selon une strategie originale associant, aux electrophoreses en champs alternes, l'utilisation de l'enzyme ceui, des gels a deux dimensions et du marquage indirect d'extremites. La carte physique a ete obtenue avec une resolution de 110 kpb. La carte genetique permet de positionner 40 genes et 11 operons ribosomiques. Ces operons sont en orientation divergente par rapport a l'origine de replication. Ces travaux ont ete integres dans la base de donnees csolvdb. L'auteur a constitue cette base de donnees sur le theme des clostridia solvantogenes en utilisant le standard acedb. L'ensemble des resultats obtenus durant cette these presente une avancee importante dans la connaissance et la maitrise de la genetique des clostridia solvantogenes. Ces travaux permettent de proposer un modele pour l'etude fonctionnelle du genome de c. Acetobutylicum atcc824 dont le sequencage systematique a ete commence en 1996.

  • Titre traduit

    Physical and genetic mapping of the genome of clostridium acetobutylicum atcc824


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  • Détails : 250 P.
  • Annexes : 520 REF.

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  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 1997/416/COR

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  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : 1997ISAT0018
  • Bibliothèque : Université Paris-Est Créteil Val de Marne. Service commun de la documentation. Section multidisciplinaire.
  • PEB soumis à condition
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