Etude par spectroscopie IRTF de la structure de triple-hélices d'acides nucléiques

par Cécile Dagneaux

Thèse de doctorat en Sciences biologiques fondamentales et appliquées. Psychologie. Sciences médicales

Sous la direction de Eliane Taillandier.

Soutenue en 1996

à Paris 13 .


  • Résumé

    On distingue trois grandes familles de triple-hélices classiques, obtenues en ciblant une séquence constituée principalement des bases puriques a et g en double-hélice. Ce sont les triple-hélices de type pyr*pur-pyr, dans lesquelles le troisième brin contient des thymines et (ou) des cytosines protonnées ; les triple-hélices de type pur*pur-pyr, dans lesquelles le troisième brin contient des guanines et (ou) des adénines et les triple-hélices mixtes, dans lesquelles le troisième brin contient des guanines et des thymines. Nous avons étudié notamment par spectroscopies ftir et UV la structure et les conditions de formation de triple-hélices classiques, formées en utilisant aussi bien des polynucléotides, que des oligonucléotides dont certains étaient modifiés (anomerie alpha ; 2'omethyl riboses, cytosines methylées). Il s'agissait notamment d'étudier la faisabilité de la triple-hélice de type pur*pur-pyr obtenue en ciblant la séquence polypurine des rétrovirus murins de friend et moloney. Nous avons ainsi montré que cibler cette séquence, conservée dans le génome des rétrovirus et composée de 13 bases, par un oligonucléotide composé des purines a et g, induit une inhibition de la prolifération du rétrovirus dans des cellules de dunni infectées de novo. Pour améliorer l'efficacité de l'utilisation des oligonucléotides formant des triple-hélices (tfo) sur les systèmes cellulaires infectés (stratégie antigènes), l'une des possibilités est d'élargir la reconnaissance par les bases de l'oligonucléotide troisième brin à des séquences contenant les quatre bases. La formation de complexes à trois brins ayant cette caractéristique est proposée en présence de protéines recombinantes. Dans ces complexes, le troisième brin constitue des quatre bases est de séquence homologue à celle d'un des brins de la double-hélice. Nous avons montré que de telles structures se forment en présence de la protéine reca d'e. Coli en solution.

  • Titre traduit

    Structural study by ftir spectroscopy of nucleic acids triple-helices


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Informations

  • Détails : 172 p.
  • Annexes : 59 ref.

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  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH 1996 053
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