Developpement de nouvelles sequences permettant l'etude par resonance magnetique nucleaire des interactions de macromolecules biologiques avec l'eau : application a des proteines et des acides nucleiques

par ANJA BOCKMANN

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de E. GUITTET.

Soutenue en 1996

à Paris 11 .

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  • Résumé

    L'analyse des interactions avec l'eau est un moyen d'approche de la structure et de la dynamique des macromolecules biologiques. Grace a des developpements recents, la resonance magnetique nucleaire est devenue un outil tres puissant pour l'observation de ces interactions. Nous proposons dans un premier chapitre de nouvelles methodes que nous avons developpees pour le travail dans et surtout avec l'eau. Nous presentons les sequences selectives snurd, eausy et wanted qui tiennent compte du phenomene de l'amortissement par rayonnement coherent qui rend delicate l'observation de l'eau a haut champ magnetique. Le deuxieme chapitre presente l'application de l'experience pseudo-3d snurd-tocsy a l'etude de l'influence du thiocyanate sur l'hydratation du bpti. Grace a notre methode, nous avons pu mettre en evidence l'influence du sel sur les vitesses d'echange des protons labiles ; l'impact sur les temps de residence des molecules d'eau internes semble, s'il est present, tres faible. Le troisieme chapitre traite l'analyse des vitesses d'echange des protons amides du domaine de liaison a l'adn de la proteine frur. Le developpement d'une experience heteronucleaire selective a la frequence de l'eau snurd-hsqc a permis l'evaluation semi-quantitative des vitesses d'echange rapides. Une comparaison des vitesses d'echange obtenues avec la probabilite pour chaque proton amide de former une liaison hydrogenes montre une bonne correlation. Dans le quatrieme chapitre nous presentons une nouvelle methode qui permet la determination quantitative des vitesses d'echange comprises entre quelques dizaines et centaines de millisecondes. Cette experience selective a la frequence de l'eau utilise le principe de mesure de diffusion pour determiner les temps de residence. Nous avons applique cette sequence a l'evaluation des vitesses d'echange des protons imino d'un 16mere d'adn. Les resultats obtenus sont en bon accord avec les mesures de transfert d'aimantation par la methode classique bidimensionnelle


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  • Détails : 277 P.
  • Annexes : 232 REF.

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  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH2014-012711
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