Etude des interactions entre la proteine ihf et son site de fixation a l'adn

par LAURENCE ZULIANELLO

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de P. VAN DE PUTTE.

Soutenue en 1996

à Paris 7 .

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  • Résumé

    Le facteur d'integration ihf est une petite proteine basique qui appartient a la famille des proteines histone-like, responsables de la compaction de l'adn dans la cellule bacterienne. Ihf participe egalement a de nombreux processus moleculaires tels la replication, la transcription et la tranposition. Le role de la proteine dans ces differents processus est essentiellement architectural: en se fixant specifiquement a l'adn, au site t/aatcaannnntta/g (n etant un des nucleotides), ihf induit une courbure de l'adn qui faciliterait la formation de complexes multi-proteiques associes a l'adn. Ihf est une proteine dimerique composee des sous-unites hima et himd qui sont homologues, mais non identiques. L'etude des interactions entre ihf et son site de fixation a l'adn a permis d'identifier les motifs proteiques favorisant cette interaction specifique. Le role joue par la sous-unite hima est determinant dans la reconnaissance de la sequence t/aatcaa. La stabilisation du complexe adn-proteine est, par contre, assuree par des interactions entre le corps de la proteine et les regions adjacentes au site de reconnaissance. L'etude de proteines mutantes et tronquees a permis de mettre en evidence une interaction entre la sous-unite himd et la region voisine de la sequence consensus tta/g. La selection in vitro d'une sequence d'adn dans la region non-conservee (nnnn) du site ihf, qui favorise la fixation de la proteine a l'adn, semble indiquer que cette region 4n est en contact avec la proteine. La region riche en base a-t, souvent identifiee en amount du site de fixation, ne semble pas etre impliquees dans la reconnaissance du site ihf par la proteine. La discussion du travail est illustree par le model de ihf qui permet de visualiser les regions proteiques qui sont probablement impliquees dans l'interaction avec l'adn


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Informations

  • Détails : 132 P.
  • Annexes : 350 REF.

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  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • Accessible pour le PEB
  • Cote : TS1996
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