Etude dea proteines a haute pression hydrostatique par simulation de dynamique moleculaire

par EMANUELE PACI

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Pierre Turq.

Soutenue en 1996

à Paris 6 .

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  • Résumé

    Cette these est une etude des proteines soumises a des pressions elevees, par des simulations de dynamique moleculaire. Le but de cette these est d'approfondir la comprehension du comportement des proteines a l'echelle atomique et moleculaire et d'aller plus loin dans l'analyse de certains resultats experimentaux. Afin d'etablir la faisabilite de simulations a haute pression pour des macromolecules biologiques, differentes methodes de simulation de dynamique moleculaire a pression et temperature constantes sont mises en oeuvre et comparees. Ces techniques sont utilisees pour examiner les modifications de structure et de volume de deux proteines globulaires, la superoxyde dismutase en solution et le lysozyme en phase cristalline, a haute pression. On etudie la surface accessible au solvant et le volume contenu dans cette surface car ces quantites jouent un role important dans la description des proteines, dans l'etude de leur interaction avec le solvant et de la stabilite des differentes conformations. Les points centrales de ce travail sont la comparaison de differentes definitions de surface et volume d'une proteine et l'interpretation de mesures experimentales de compressibilite.


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Informations

  • Détails : 145 P.
  • Annexes : 107 REF.

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Accessible pour le PEB
  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1996
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