Dynamique des populations d'elements transposables : modelisation et validation

par HADI QUESNEVILLE

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de D. ANXOLABEHERE.

Soutenue en 1996

à Paris 6 .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    L'impact generalement negatif des elements transposables sur la survie de leurs hotes, pose le probleme de leur maintien au sein des populations. De nombreuses etudes par modelisation ont tente de repondre a cette question. Nous nous sommes interesse a la validite des approches utilisees pour tester ces modeles. Notre analyse montre que ces methodes ne permettent pas de les valider. Nous proposons alors une nouvelle approche qui a l'inverse des methodes proposees, consiste a tester par simulation, un modele specifique a une famille d'elements transposables. Nous avons realise un modele de la dynamique d'invasion de l'element transposable p chez drosophila melanogaster. Sa validation a ete realisee grace a la construction d'un environnement de simulation. Nos resultats montrent un effet du chromosomes x sur la distribution des copies. En integrant des migrations recurrentes, le modele permet d'expliquer la repartition mondiale des copies de cet element, et permet de proposer un modele de migration. L'environnement de simulation que nous avons construit, constitue un outil permettant d'etudier le modele dans des especes proches de drosophila melanogaster, et de simuler d'autres modeles de dynamique d'elements transposables. Enfin, nous avons concu un algorithme d'optimisation adapte aux problemes rencontres en optimisation par simulation. Base sur un algorithme genetique, il optimise un grand nombre de parametres, limite le bruit stochastique des evaluations par simulation, et economise du temps de calcul

  • Titre traduit

    Population dynamics of transposable elements: modelisation and validation


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Informations

  • Détails : 197 P.
  • Annexes : 264 REF.

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  • Consultable sur place dans l'établissement demandeur
  • Cote : T Paris 6 1996 346
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  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1996
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