Etudes structurales par rmn d'oligonucleotides contenant soit une paire de bases non complementaires soit une lacune d'un nucleotide

par VALERIE FAIBIS

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de V. FAZAKERLEY.

Soutenue en 1996

à Paris 6 .

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  • Résumé

    La connaissance precise de la structure d'un adn modifie, en particulier au niveau du site de lesion, peut fournir des informations tres utiles pour la comprehension des mecanismes de mutations et de reparations de ces lesions. Dans ce but, nous avons determine par rmn la structure d'oligonucleotides contenant differentes lesions. Dans un premier temps, nous avons etudie par rmn et modelisation moleculaire deux mesappariements, g. G et i. I, incorpores en position centrale dans la sequence 29-39 du proto-oncogene k-ras. Cette position correspond a un point chaud de mutation. Pour les deux mesappariements, l'appariement entre les deux bases, de type wobble, s'effectue au moyen d'une seule liaison hydrogene. Les spectres rmn ont montre l'existence de deux conformations, symetriques par rapport a l'axe pseudodyadique, et caracterisees par dynamique moleculaire. Pour le mesappariement i. I, nous avons observe par rmn une espece minoritaire pour laquelle l'une ou l'autre des inosines est en conformation syn. Ces etudes ont pu etre integrees a celle deja realisees au sein du laboratoire pour proposer des parametres explicatifs des differences d'efficacite de reparation observees experimentalement. Dans la deuxieme partie de ce travail, nous avons expose les resultats de rmn concernant la structure d'oligonucleotides comportant une guanine ou une cytosine opposee a une lacune d'un residu. En ce qui concerne le premier oligonucleotide, nous avons montre que la guanine opposee au site de lesion est inseree dans l'helice. La structure globale du duplex ne devie quasiment pas d'une helice d'adn b. En ce qui concerne le deuxieme oligonucleotide, nous avons determine que la cytosine opposee au site de lesion peut adopter deux positions, intra-helicoidale et extra-helicoidale. Les perturbations structurales peuvent se propager au niveau de la cytosine adjacente qui peut egalement adopter ces deux conformations. Ces resultats demontrent que la structure d'un oligonucleotide contenant une lacune d'un residu est influencee par la nature de la base faisant face au site de lesion et par la sequence environnante


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Informations

  • Détails : 151 P.
  • Annexes : 253 REF.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Centre Technique du Livre de l'Enseignement supérieur (Marne-la-Vallée, Seine-et-Marne).
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : PMC RT P6 1996
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