Etude structurale par rmn en solution d'une thioredoxine h ch1 de l'algue verte chlamydomonas reinhardtii

par VIRGINIE MITTARD

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de J.-M. LANCELIN.

Soutenue en 1996

à Grenoble 1 .


  • Résumé

    Les thioredoxines representent un interet particulier en biologie structurale depuis que ces proteines ubiquitaires d'environ 12 kda ont ete trouvees etre impliquees dans de nombreux roles biochimiques differents incluant des fonctions regulatrices comme l'activation d'enzymes specifiques ou encore la regulation de l'expression genetique. Ces fonctions reposent principalement sur le mecanisme redox a travers l'echange dithiol-disulfure dans la sequence conservee w-c-g-p-c. Une etude structurale de la thioredoxine h ch1 de l'algue verte chlamydomonas reinhardtii a donc ete entreprise pour essayer de progresser dans la comprehension au niveau moleculaire des relations structure-fonction encore inconnues de cette proteine. Au cours de cette etude, l'attribution des resonances (#1h, #1#3c, #1#5n) a tout d'abord ete realisee et des contraintes de distances pour le calcul de structures ont ete deduites. Nous avons ainsi pu resoudre cette thioredoxine dans sa forme oxydee sur la base de 1904 contraintes de distances rmn incluant 90 contraintes sur 45 liaisons hydrogene et 44 contraintes sur les angles diedres phi. Un ensemble de 23 structures convergentes a ete obtenu avec un rmsd de 0,8 a 0,16 pour les atomes (n, ca, c) du squelette en considerant la superposition des residus 4 a 110 par rapport a la moyenne. Par comparaison aux autres structures 3d de thioredoxines resolues a ce jour, les modeles obtenus ici ont montre une plus grande homologie structurale vis-a-vis de la thioredoxine humaine que des thioredoxines bacteriennes (anabaena, escherichia coli) ou d'une thioredoxine m ch2 de cette algue verte. Un examen minutieux du potentiel electrostatique moyenne associe aux surfaces accessibles indique par ailleurs qu'une interaction thioredoxine h substrat pourrait etre similaire a celle existante chez les vertebres, notamment celle impliquant la thioredoxine humaine dans la regulation des facteurs de transcription de type nf-kb


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  • Détails : 180 P.
  • Annexes : 184 REF.

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