Effet de la plante et du sol sur la diversite des populations telluriques de Pseudomonas SPP. Fluorescents

par Xavier Latour

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Philippe Lemanceau.

Soutenue en 1996

à Dijon .

mots clés

• Pseudomonas
• Rhizosphère

Résumé

Les pseudomonas SPP. Fluorescents sont des bactéries antagonistes de nombreux champignons phytopathogènes. La protection biologique des cultures, assurée par certaines souches, résulte de leurs activités antagonistes et de leur aptitude à se maintenir dans la rhizosphère de la plante inoculée. Les caractères microbiens responsables de l'adaptation des Pseudomonas SPP. Fluorescents à la rhizosphère sont relativement méconnus. Afin de mieux comprendre le déterminisme de l'adaptation à la rhizosphère de ces bactéries, les caractéristiques de Pseudomonas SPP. Fluorescents isolés de sols nus et de racines de plantes cultivées sur ces mêmes sols ont été comparées. L'étude a porté sur plus de 600 souches isolées de 2 sols ou des racines de lin et tomate cultivées dans ces mêmes sols. La diversité a été évaluée aux niveaux phénotypique (tests biochimiques et physiologiques) et génotypique (PCR-RFLP du 16S, PCR-REP, profils plasmidiques). La distribution des isolats au sein des différents phénons en fonction de leur origine montrent clairement que (i) la plante exerce une sélection à l'égard des populations de Pseudomonas SPP. Fluorescents, et cette sélection est en partie spécifique de l'espèce végétale ; (ii) les populations de Pseudomonas SPP. Fluorescents diffèrent d'un sol nu a l'autre ; (iii) les populations associées à une même espèce végétale diffèrent également d'un sol à l'autre. Les résultats obtenus suggèrent que la pression de sélection exercée par la plante est liée au métabolisme basal des Pseudomonas et plus particulièrement à leur aptitude à assimiler certains substrats organiques et a réduire les nitrates

Titre traduit

Effect of the plant and of the soil type on the diversity of soilborne populations of fluorescent pseudomonads

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