Effet de la plante et du sol sur la diversite des populations telluriques de pseudomonas spp. Fluorescents

par Xavier Latour

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de P. LEMANCEAU.

Soutenue en 1996

à Dijon .

mots clés

Résumé

Les pseudomonas spp. Fluorescents sont des bacteries antagonistes de nombreux champignons phytopathogenes. La protection biologique des cultures, assuree par certaines souches, resulte de leurs activites antagonistes et de leur aptitude a se maintenir dans la rhizosphere de la plante inoculee. Les caracteres microbiens responsables de l'adaptation des pseudomonas spp. Fluorescents a la rhizosphere sont relativement meconnus. Afin de mieux comprendre le determinisme de l'adaptation a la rhizosphere de ces bacteries, les caracteristiques de pseudomonas spp. Fluorescents isoles de sols nus et de racines de plantes cultivees sur ces memes sols ont ete comparees. L'etude a porte sur plus de 600 souches isolees de 2 sols ou des racines de lin et tomate cultivees dans ces memes sols. La diversite a ete evaluee aux niveaux phenotypique (tests biochimiques et physiologiques) et genotypique (pcr-rflp du 16s, pcr-rep, profils plasmidiques). La distribution des isolats au sein des differents phenons en fonction de leur origine montrent clairement que (i) la plante exerce une selection a l'egard des populations de pseudomonas spp. Fluorescents, et cette selection est en partie specifique de l'espece vegetale ; (ii) les populations de pseudomonas spp. Fluorescents different d'un sol nu a l'autre ; (iii) les populations associees a une meme espece vegetale different egalement d'un sol a l'autre. Les resultats obtenus suggerent que la pression de selection exercee par la plante est liee au metabolisme basal des pseudomonas et plus particulierement a leur aptitude a assimiler certains substrats organiques et a reduire les nitrates

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