Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
Sous la direction de P. LEMANCEAU.
Soutenue en 1996
à Dijon .
Les pseudomonas spp. Fluorescents sont des bacteries antagonistes de nombreux champignons phytopathogenes. La protection biologique des cultures, assuree par certaines souches, resulte de leurs activites antagonistes et de leur aptitude a se maintenir dans la rhizosphere de la plante inoculee. Les caracteres microbiens responsables de l'adaptation des pseudomonas spp. Fluorescents a la rhizosphere sont relativement meconnus. Afin de mieux comprendre le determinisme de l'adaptation a la rhizosphere de ces bacteries, les caracteristiques de pseudomonas spp. Fluorescents isoles de sols nus et de racines de plantes cultivees sur ces memes sols ont ete comparees. L'etude a porte sur plus de 600 souches isolees de 2 sols ou des racines de lin et tomate cultivees dans ces memes sols. La diversite a ete evaluee aux niveaux phenotypique (tests biochimiques et physiologiques) et genotypique (pcr-rflp du 16s, pcr-rep, profils plasmidiques). La distribution des isolats au sein des differents phenons en fonction de leur origine montrent clairement que (i) la plante exerce une selection a l'egard des populations de pseudomonas spp. Fluorescents, et cette selection est en partie specifique de l'espece vegetale ; (ii) les populations de pseudomonas spp. Fluorescents different d'un sol nu a l'autre ; (iii) les populations associees a une meme espece vegetale different egalement d'un sol a l'autre. Les resultats obtenus suggerent que la pression de selection exercee par la plante est liee au metabolisme basal des pseudomonas et plus particulierement a leur aptitude a assimiler certains substrats organiques et a reduire les nitrates
Effect of the plant and of the soil type on the diversity of soilborne populations of fluorescent pseudomonads
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