Ecologie des bactéries sulfato-réductrices en milieu lagunaire : minéralisation de la matière organique et fixation de l'azote atmosphérique

par Sophie Bourgues

Thèse de doctorat en Océanographie

Sous la direction de Pierre Caumette.

Soutenue en 1996

à Bordeaux 1 .


  • Résumé

    La population des bacteries sulfato-reductrices est etudiee en relation avec les macrophytes dominants de deux lagunes. Deux aspects de l'ecologie de ces micro-organismes sont developpes et discutes, a savoir leur role dans la mineralisation de la matiere organique d'origine vegetale ainsi que leur role dans le processus de fixation de l'azote atmospherique. La degradation de deux types de macrophytes, la phanerogame zostera noltii et la macro-algue verte monostroma obscurum, a ete etudiee en laboratoire dans des conditions d'anoxie et d'obscurite se rapprochant des conditions existant au sein du sediment. La decomposition de cette matiere vegetale s'accompagne d'un relargage important de sels nutritifs azotes et phosphates ainsi que d'une forte production de sulfures. Nous avons estime que plus de 75% de la mineralisation du carbone vegetal etait assuree par la sulfato-reduction. Le cycle du soufre a ete etudie in situ au sein du sediment de deux ecosystemes lagunaires que constituent le bassin d'arcachon et l'etang du prevost. Au cours d'un cycle annule, nous avons quantifie la population des bacteries sulfato-reductrices et celle des bacteries sulfo-oxydantes aerobies par la methode du nombre le plus probable. Cette methode de denombrement a ete optimisee sur le plan technique afin de pouvoir comparer les populations in situ aux niveaux spatial et temporel. L'activite de ces micro-organismes a egalement ete quantifiee au sein des memes sediments. L'ensemble de ces mesures a permis de mettre en evidence une activite de sulfato-reduction intense au sein des herbiers de phanerogames du bassin d'arcachon, qui a ete comparable a celle quantifiee au niveau de l'etang du prevost, ecosysteme tres eutrophe et soumis a d'importantes proliferations algales. Plusieurs facteurs tampons sont proposes pour expliquer l'absence de phenomenes dystrophiques au sein du bassin d'arcachon. Nous avons demontre qu'au niveau des sediments colonises par zostera noltii, la fixation de l'azote atmospherique etait essentiellement assuree par les bacteries sulfato-reductrices. Ce processus contribuerait a pourvoir approximativement 10% des besoins en azote des plantes. L'ecophysiologie de cette activite diazotrophe (capacite a fixer l'azote atmospherique) a ete plus particulierement etudiee sur deux souches sulfato-reductrices isolees de la rhizosphere des phanerogames, apparentees au genre desulfovibrio


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  • Détails : [xii], 165 p.

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  • Bibliothèque : Université de Bordeaux. Direction de la Documentation. Bibliothèque Sciences et Techniques.
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  • Cote : FT 96.B-1505
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  • Cote : FTR 96.B-1505
  • Bibliothèque : Université de Bordeaux. Direction de la Documentation. Bibliothèque de la Station Marine d'Arcachon.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : TH BOU 25
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